將荷爾蒙與代謝物相關聯(組學數據)大家好,
我試圖從我公司的組學數據中找到不同生長階段荷爾蒙和代謝物表現之間的相關性。 我用 4 列建構數據:類型(激素或代謝物)、名稱(所述化合物)、相(A、B、C 或 D)和標準化相平均值(這是原始數據,即表達量各化合物。 我已經對每種類型進行了標準化並按階段進行了平均)。 如有必要,我可以重組數據。
我正在考慮製作一個圖表,其中 Y 軸上有激素,X 軸上有代謝物,看起來像是帶有相關性/熱圖的多元圖。 我想為每個成長階段製作一張圖表,然後可能同時為所有階段的整體相關性製作一張圖表。
我嘗試在圖形生成器中進行此操作並使用“分析”>“多元”,但兩者都不起作用。 由於前三列的分類性質,多元不會讓我這樣做。
請幫幫我,我該怎麼辦?
進階統計建模基礎資料分析與建模回覆:將荷爾蒙與代謝物相關聯(組學數據)你好,
如果沒有資料佈局的範例(可以使用模擬資料),則很難為您提供準確的回饋。 不過,您應該考慮的第一件事是將代謝物和荷爾蒙數據分成單獨的欄位。 事實上,JMP 需要將 X 和 Y 資料放在不同的欄位中。
其次,您可以建立一個 GraphBuilder 繪圖,其中荷爾蒙數據為 X,代謝物數據為 Y,階段為 WRAP 因子。
然後,您可以使用相關橢圓+點圖顯示來視覺化荷爾蒙和代謝物之間的關係。 最後,在繪圖區域旁的左側互動選單中,您可以選擇顯示每個面板的 r 方和相關性。
讓我們知道這是否有效。
抱歉,如果這個解釋是微不足道的
最好的
TS
回覆:將荷爾蒙與代謝物相關聯(組學數據)你好@科頓_King ,
聽起來您的資料已堆疊(單列中的值)。 您可以嘗試拆分數據,以便每種激素和代謝物都有自己的值列。 然後 Multivariate 將使用這些新列。 另請參閱簇變數。 它將為您提供相關性的熱圖並對它們進行聚類。
乾杯,