寻找最佳 DOE 设计大家好,
我正在努力寻找最佳的 DOE 设计,以便为我的协议找到最佳条件。
我查看了文档,为许多网络研讨会提供了帮助,但无法找到最好的一个。 所以我需要你的帮助。
我有 2 个分类响应(4 个级别)、1 个连续因子和 1 个分类(2 个级别)因子。
我的连续因素是试剂的浓度。 我需要为此添加阴性对照,这意味着我想查看该因子浓度为 0 时的结果。 我研究生物样品,不能选择这种阴性对照。
我尝试了自定义设计,但没有获得连续因子的值范围。
所以我尝试了空间填充设计,但是,尽管给了我大量的测试,这个设计并没有使用值 0 作为我的连续因子。
非常感谢您提供的任何见解和帮助。
玛丽
实验设计回复:寻找最佳 DOE 设计你好@mgerusdurand ,
您需要在模型大纲中为连续因子添加高阶项(此处为 X1):

这将为您提供一个使用更多 X1 值的设计。
一些可能有帮助的解释......
默认模型是主效应模型,估计连续因子主效应的游程的最佳位置位于范围的低值和高值处。 将运行置于低值和高值极值是估计连续因子的简单线性主效应的最佳方法。 定制设计正在做它应该做的事情:为您提供最佳设计来估计您指定的模型。 当您在模型中指定高阶项时,这会强制“自定义设计”将游程放置在范围的中间 - 您需要中间的点来估计曲线。
需要考虑的另一点是,从分类响应中获得洞察力比连续响应更具挑战性。 分类响应中的信息比连续响应中的信息少,因此您通常需要在实验中进行更多运行才能了解有关系统的有用信息。 如果可以的话,最好使用连续响应。
我希望这有帮助,
披
回复:寻找最佳 DOE 设计玛丽,
我不了解您的情况,所以我有一些问题/意见:
1. 我不明白你所说的“最好的”能源部是什么意思。首先,你如何定义最佳? 不太可能有人能做到这一点,所以我的建议是创建多个设计并比较和对比它们(精度、分辨率、推理空间、效率等)。预测每个实验可能提供哪些信息/知识,并将其与所需的资源进行权衡。
2. 我完全同意 Phil 的观点,即使用分类响应变量可能非常低效。您将缺乏区分度,尤其是少于 5 个类别的情况。这通常会导致需要大量样本进行评估。 了解响应是什么会很有帮助,因为我们可能会提供有关如何修改它们的想法,但请理解这可能是专有的。
3. 我对你的一些说法感到困惑。它们似乎是矛盾的:
”我需要为此添加阴性对照......”和“阴性对照不是一种选择”?
进而 ”此设计不使用值 0 作为我的连续因子。”
那么你想要 0 作为实验中的水平还是不希望连续因子呢?
回复:寻找最佳 DOE 设计如果将阴性对照保留在最后并在“自定义设计”制作数据表后手动添加,您也许能够简化实验设计。 该设计是关于估计模型参数。 控制是为了保证运行。 将它们分开会更容易。 您可能希望从回归分析中排除控制行,但不要将其从图中隐藏以帮助您进行评估。
您的案例也可能受益于使用离散数字因子而不是连续因子。 您可以通过这种方式指定您需要的级别。@菲尔_凯解释了设计和模型之间的关系。 如果您选择离散数值因子,则将 JMP 自动添加的模型中的高阶项保留。
回复:寻找最佳 DOE 设计谢谢菲尔。
响应是离散数字,要获得定量响应(连续),这将涉及我需要包含其他因素的其他过程。 如果提出的模型仍然不是最佳的,我可能会考虑它。
我会先尝试添加更高的订单。
感谢您的帮助
玛丽
回复:寻找最佳 DOE 设计你好@statman ,
我可能不会用 DOE 语言说话,抱歉我是新手。
1. 对我来说最好的 DOE 将允许涵盖所有值范围。 只有极端的限制不允许我根据我对正在评估的生物过程的了解获得正确的信息。 我想找到能源部来帮助我获得最相关的信息。
2. 我们的反应(可报告参数)取决于我们的目标,并且通常是明确的。 在 IVD 环境中工作时,您无法选择需要评估的输出,不幸的是,在这种情况下,它是分类 4 个级别。 如果我想使用定量数据,这涉及其他过程,那么这是一个全新的故事。
3. 我需要一个阴性对照来检查我观察到的响应是否是由于试剂的存在(其浓度是我的连续因子)。 因此,我需要进行一些连续因子为 0 的测试,以便我可以评估该试剂对我的响应的影响。
希望这是一个更好的解释
玛丽
回复:寻找最佳 DOE 设计你好@马克贝利,
感谢您的意见。 事实上,在最后添加我的控制可能会有所帮助。 我只需要确保之后可以将其添加到模型中,因为我需要确保如果我从测试中得到的结果与从控制中得到的结果相同,则可以将其考虑在内,可以将其丢弃。 不确定我是否解释得很好。
我也会尝试离散数字来看看它是如何工作的。
再次感谢你的帮助,
玛丽