Alla ricerca del miglior design DOECiao a tutti,
Sto lottando per trovare il miglior design DOE per trovare le migliori condizioni per il mio protocollo.
Ho esaminato la documentazione, assistito a molti webinar ma non riesco a trovare quello migliore. Quindi ho bisogno del tuo aiuto su questo.
Ho 2 risposte categoriche (4 livelli), 1 fattore continuo e 1 fattore categorico (2 livelli).
Il mio fattore continuo è la concentrazione di un reagente. Devo includere il controllo negativo per questo, il che significa che voglio vedere il risultato quando la concentrazione di questo fattore è 0. Lavoro su campioni biologici e questo controllo negativo non è un'opzione.
Ho provato Custom Design ma non ho ottenuto un intervallo di valore per il mio fattore continuo.
Quindi ho provato Space Filling Design ma, nonostante mi abbia dato una grande quantità di test, questo design non usa il valore 0 per il mio fattore continuo.
Molte grazie per qualsiasi intuizione, aiuto che potresti avere.
Maria
Progettazione di esperimentiRe: Alla ricerca del miglior design DOECIAO @mgerusdurand ,
È necessario aggiungere termini di ordine superiore nella struttura del modello per il fattore continuo (X1 qui):
Questo dovrebbe darti un design che utilizza più valori per X1.
Qualche spiegazione che potrebbe aiutare...
Il modello predefinito è un modello a effetti principali e il posizionamento ottimale delle esecuzioni per stimare l'effetto principale di un fattore continuo è agli estremi basso e alto dell'intervallo. Posizionare le corse agli estremi basso e alto è il migliore per stimare un semplice effetto principale lineare di un fattore continuo. Custom Design sta facendo quello che dovrebbe fare: darti il design ottimale per la stima del modello che hai specificato. Quando si specificano termini di ordine superiore nel modello, ciò costringe Custom Design a posizionare le sequenze nel mezzo dell'intervallo: sono necessari punti nel mezzo per stimare una linea curva.
Un altro punto da considerare è che è più difficile ottenere informazioni da risposte categoriche che da risposte continue. Ci sono meno informazioni in una risposta categorica rispetto a una risposta continua, quindi in genere hai bisogno di più esecuzioni nel tuo esperimento per imparare qualcosa di utile sul sistema. Se puoi, è meglio usare una risposta continua.
Spero che aiuti,
Phi
Re: Alla ricerca del miglior design DOEMaria,
Non capisco la tua situazione, quindi ho alcune domande/commenti:
1. Non capisco cosa intendi per DOE "migliore".Innanzitutto, come definisci meglio? È improbabile che chiunque possa farlo, quindi il mio consiglio è di creare più progetti e confrontarli e contrastarli (precisione, risoluzione, spazio di inferenza, efficienza, ecc.).Prevedi quali informazioni/conoscenze sono possibili da ciascun esperimento e confrontale con le risorse richieste.
2. Sono completamente d'accordo con Phil sul fatto che l'utilizzo di variabili di risposta categoriche può essere molto inefficiente.Ti mancherà la discriminazione soprattutto con meno di 5 categorie.Questo di solito comporta la necessità di campioni di grandi dimensioni da valutare. Sarebbe utile sapere quali sono le risposte in quanto potremmo fornire idee su come modificarle, ma capire che questo potrebbe essere proprietario.
3. Sono confuso da alcune delle tue affermazioni.Sembrano contraddittori:
" Devo includere il controllo negativo per quello..." e "il controllo negativo non è un'opzione"?
poi " questo disegno non usa il valore 0 per il mio fattore continuo."
Quindi vuoi 0 come livello nell'esperimento o no per il fattore continuo?
Re: Alla ricerca del miglior design DOEPotresti essere in grado di semplificare la progettazione del tuo esperimento se lasci il controllo negativo fino alla fine e lo aggiungi manualmente dopo che Custom Design ha creato la tabella dei dati. Il progetto riguarda la stima dei parametri del modello. I controlli riguardano la garanzia delle corse. Separarli renderà più facile. Potresti voler escludere la riga di controllo dall'analisi di regressione ma non nasconderla dai grafici per facilitare la tua valutazione.
Il tuo caso potrebbe anche trarre vantaggio dall'utilizzo di un fattore numerico discreto invece di un fattore continuo. Puoi specificare i livelli di cui hai bisogno in questo modo.@Phil_Kay ha spiegato come il design e il modello sono correlati. Lasciare i termini di ordine superiore nel modello che JMP aggiunge automaticamente se si sceglie un fattore numerico discreto.
Re: Alla ricerca del miglior design DOEGrazie Fil.
Le risposte sono numeriche discrete, per ottenere quelle quantitative (continue) ciò comporterà altri processi per i quali avrei bisogno di includere altri fattori. Potrei prenderlo in considerazione se il modello proposto non fosse ancora ottimale.
Proverò ad aggiungere prima un ordine superiore.
Grazie per l'aiuto
Maria
Re: Alla ricerca del miglior design DOECiao @statman ,
Potrei non aver parlato in lingua DOE, mi dispiace sono un principiante.
1. Il miglior DOE per me consentirà di coprire tutta la gamma di valori. Avere solo limiti estremi non mi ha permesso di ottenere le giuste informazioni basate sulla mia conoscenza del processo biologico che sto valutando. Voglio trovare il DOE che mi aiuterà a ottenere le informazioni più rilevanti.
2. Le nostre risposte (parametri segnalabili) dipendono dai nostri obiettivi e sono spesso categoriche. Quando lavori in un ambiente IVD non hai la scelta dell'output che devi valutare e sfortunatamente in questo caso si tratta di 4 livelli categorici. Se voglio utilizzare dati quantitativi, questo ha comportato altri processi e quindi è una storia completamente nuova.
3. Ho bisogno di un controllo negativo per verificare che la risposta che ho osservato sia dovuta alla presenza del reagente (la cui concentrazione è il mio fattore continuo). Quindi ho bisogno di un test in cui il mio fattore continuo è 0 in modo da poter valutare questo effetto del reagente sulla mia risposta.
Spero che questa sia una spiegazione migliore,
Maria
Re: Alla ricerca del miglior design DOECiao @Mark_Bailey ,
Grazie per l'input. In effetti aggiungere il mio controllo alla fine potrebbe aiutare. Avrei solo bisogno di essere sicuro di poterlo aggiungere al modello dopo perché devo assicurarmi che questo prenderà in considerazione se ottengo gli stessi risultati da un test che dal controllo questo può essere scartato. Non so se mi spiego bene.
Proverò anche il discreto numerico per vedere come funziona.
Grazie ancora per il vostro aiuto,
Maria
