尋找最佳 DOE 設計大家好,
我正在努力尋找最佳的 DOE 設計,以便為我的協議找到最佳條件。
我查看了文檔,為許多網絡研討會提供了幫助,但無法找到最好的一個。 所以我需要你的幫助。
我有 2 個分類響應(4 個級別)、1 個連續因子和 1 個分類(2 個級別)因子。
我的連續因素是試劑的濃度。 我需要為此添加陰性對照,這意味著我想查看該因子濃度為 0 時的結果。 我研究生物樣品,不能選擇這種陰性對照。
我嘗試了自定義設計,但沒有獲得連續因子的值範圍。
所以我嘗試了空間填充設計,但是,儘管給了我大量的測試,這個設計並沒有使用值 0 作為我的連續因子。
非常感謝您提供的任何見解和幫助。
瑪麗
實驗設計回复:尋找最佳 DOE 設計你好@mgerusdurand ,
您需要在模型大綱中為連續因子添加高階項(此處為 X1):

這將為您提供一個使用更多 X1 值的設計。
一些可能有幫助的解釋......
默認模型是主效應模型,估計連續因子主效應的遊程的最佳位置位於範圍的低值和高值處。 將運行置於低值和高值極值是估計連續因子的簡單線性主效應的最佳方法。 定制設計正在做它應該做的事情:為您提供最佳設計來估計您指定的模型。 當您在模型中指定高階項時,這會強制“自定義設計”將游程放置在範圍的中間 - 您需要中間的點來估計曲線。
需要考慮的另一點是,從分類響應中獲得洞察力比連續響應更具挑戰性。 分類響應中的信息比連續響應中的信息少,因此您通常需要在實驗中進行更多運行才能了解有關係統的有用信息。 如果可以的話,最好使用連續響應。
我希望這有幫助,
披
回复:尋找最佳 DOE 設計瑪麗,
我不了解您的情況,所以我有一些問題/意見:
1. 我不明白你所說的“最好的”能源部是什麼意思。首先,你如何定義最佳? 不太可能有人能做到這一點,所以我的建議是創建多個設計並比較和對比它們(精度、分辨率、推理空間、效率等)。預測每個實驗可能提供哪些信息/知識,並將其與所需的資源進行權衡。
2. 我完全同意 Phil 的觀點,即使用分類響應變量可能非常低效。您將缺乏區分度,尤其是少於 5 個類別的情況。這通常會導致需要大量樣本進行評估。 了解響應是什麼會很有幫助,因為我們可能會提供有關如何修改它們的想法,但請理解這可能是專有的。
3. 我對你的一些說法感到困惑。它們似乎是矛盾的:
”我需要為此添加陰性對照......”和“陰性對照不是一種選擇”?
進而 ”此設計不使用值 0 作為我的連續因子。”
那麼你想要 0 作為實驗中的水平還是不希望連續因子呢?
回复:尋找最佳 DOE 設計如果將陰性對照保留在最後並在“自定義設計”製作數據表後手動添加,您也許能夠簡化實驗設計。 該設計是關於估計模型參數。 控制是為了保證運行。 將它們分開會更容易。 您可能希望從回歸分析中排除控制行,但不要將其從圖中隱藏以幫助您進行評估。
您的案例也可能受益於使用離散數字因子而不是連續因子。 您可以通過這種方式指定您需要的級別。@菲爾_凱解釋了設計和模型之間的關係。 如果您選擇離散數值因子,則將 JMP 自動添加的模型中的高階項保留。
回复:尋找最佳 DOE 設計謝謝菲爾。
響應是離散數字,要獲得定量響應(連續),這將涉及我需要包含其他因素的其他過程。 如果提出的模型仍然不是最佳的,我可能會考慮它。
我會先嘗試添加更高的訂單。
感謝您的幫助
瑪麗
回复:尋找最佳 DOE 設計你好@statman ,
我可能不會用 DOE 語言說話,抱歉我是新手。
1. 對我來說最好的 DOE 將允許涵蓋所有值範圍。 只有極端的限制不允許我根據我對正在評估的生物過程的了解獲得正確的信息。 我想找到能源部來幫助我獲得最相關的信息。
2. 我們的反應(可報告參數)取決於我們的目標,並且通常是明確的。 在 IVD 環境中工作時,您無法選擇需要評估的輸出,不幸的是,在這種情況下,它是分類 4 個級別。 如果我想使用定量數據,這涉及其他過程,那麼這是一個全新的故事。
3. 我需要一個陰性對照來檢查我觀察到的響應是否是由於試劑的存在(其濃度是我的連續因子)。 因此,我需要進行一些連續因子為 0 的測試,以便我可以評估該試劑對我的響應的影響。
希望這是一個更好的解釋
瑪麗
回复:尋找最佳 DOE 設計你好@馬克貝利,
感謝您的意見。 事實上,在最後添加我的控制可能會有所幫助。 我只需要確保之後可以將其添加到模型中,因為我需要確保如果我從測試中得到的結果與從控制中得到的結果相同,則可以將其考慮在內,可以將其丟棄。 不確定我是否解釋得很好。
我也會嘗試離散數字來看看它是如何工作的。
再次感謝你的幫助,
瑪麗