Bonjour,
Je mets en place une expérience où je mesure les changements dans le nombre de cellules en réponse à la concentration de 8 ingrédients de milieux de culture cellulaire différents (c'est-à-dire des facteurs continus). Un DSD avec 8 exécutions supplémentaires me donne une expérience de 29 exécutions pour cela. Étant donné que le principal puits de temps de cette expérience consiste à composer les différents mélanges de médias, je prévois d'exécuter 3 répliques exactes, de préférence bloquées car les répliques seront dans différentes plaques à 96 puits et les différences de manipulation (par exemple, le temps non passé dans l'incubateur, etc.) peut entraîner une croissance différentielle. Tout est assez facile à configurer en augmentant le DSD.
| Courir | Mélange de médias | Bloc | Réponse |
| 1 | 1 | 1 | ? |
| ... | ... | ... | ... |
| 28 | 28 | 1 | ? |
| 29 | 29 | 1 | ? |
| 30 | 1 | 2 | ? |
Cependant, je recueille également des données sur plusieurs jours (mesure non invasive du nombre de cellules) de ces séries, jusqu'à 7 fois. Je m'attends à ce que la différence entre les traitements augmente en raison de la croissance exponentielle des cellules jusqu'à un certain point, puis diminue à nouveau à mesure qu'elles manquent d'espace. Je pourrais ajuster les modèles aux données des jours individuels et utiliser celui avec les meilleures PValues, mais cela semble être un gaspillage de données de ne pas tout intégrer dans un seul modèle.
Cependant, d'après ce que je comprends, si je n'utilisais qu'une seule variable de blocage et mettais toutes les combinaisons répétition/jour dans des blocs séparés (voir ci-dessous), je créerais un crénelage de la variabilité de réponse due à différents jours et différentes répliques.
| Courir | Mélange de médias | Jour | Bloc | Réponse |
| 1 | 1 | 1 | 1 | ? |
| ... | ... | ... | ... | ... |
| 28 | 28 | 1 | 1 | ? |
| 29 | 29 | 1 | 1 | ? |
| 30 | 1 | 1 | 2 | ? |
| ... | ... | ... | ... | ... |
| 87 | 29 | 1 | 3 | ? |
| 88 | 1 | 2 | 4 | ? |
Est-il possible d'utiliser deux variables bloquantes pour contourner ce problème ?
| Courir | Mélange de médias | Jour | Bloc A | Bloc B | Réponse |
| 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ? |
| ... | ... | ... | ... | ... | ... |
| 28 | 28 | 1 | 1 | 1 | ? |
| 29 | 29 | 1 | 1 | 1 | ? |
| 30 | 1 | 1 | 2 | 1 | ? |
| ... | ... | ... | ... | ... | ... |
| 87 | 29 | 1 | 3 | 1 | ? |
| 88 | 1 | 2 | 1 | 2 | ? |
J'espère que ce que je demande a du sens. Je pense que je pourrais alternativement mettre le jour comme facteur catégorique, mais je ne veux pas qu'un modèle l'inclue, donc cela semble inutile.
