실험 설계안녕하세요 여러분,
우선, 제가 영어를 모국어로 사용하는 사람이 아니기 때문에 죄송합니다. 저는 실험 디자인 분야의 초보자이기 때문에 통찰력을 찾고 있습니다. 내 문제는 다음과 같습니다.
1. 우리가 사용하는 세포배양배지에 포함된 7가지 단백질의 농도를 최적화해야 합니다.
2. 우리는 이 7가지 단백질이 모두 반응(수율)에 중요한 영향을 미친다는 것을 알고 있습니다.
3. 단백질 사이에 어떤 상호작용이 있는지는 알 수 없습니다.
4. 우리는 일부 단백질의 효과가 농도에 선형적이지 않다는 것을 알고 있습니다. 이는 평소보다 농도가 높을 때 수율에 부정적인 영향을 미칠 수 있음을 의미합니다(가능한 2차 효과).
5. 세포배양의 출발물질로 사용되는 세포가 수율에 큰 영향을 미치는 것도 알고 있으나, 그 요인을 통제할 수 없기 때문에 차단 요인으로 활용하는 방안을 고민하고 있습니다.
내 질문은 다음과 같습니다.
- 어떻게 시작하나요? 우리가 세운 첫 번째 계획에서 차단 요소를 평가합니까?
- 요인당 3가지 수준(단백질 농도)을 사용해야 합니까, 아니면 분석 수를 줄이기 위해 2가지 수준을 사용해야 합니까(그러나 2차 효과를 놓칠 수 있음)
미리 감사드립니다.
소비자 및 시장 조사실험 설계Re: 실험 설계안녕 @에코카세 ,
실험을 설계하고 실행하기 전에 생각해야 할 모든 사항을 다룰 수는 없습니다. 그러나 몇 가지 아이디어를 제공하게 되어 기쁩니다.
몇 가지 중요한 질문:
얼마나 많은 분석을 실행할 수 있습니까?
얼마나 많은 세포 출발 물질 배치가 있습니까?
세포 시작 물질의 각 배치에서 몇 개의 분석을 실행할 수 있습니까?
최종 선별 설계는 좋은 출발점이 될 수 있습니다. 이것은 상대적으로 작은 실험을 제공합니다(예: 3개의 블럭과 3개의 중심점이 있는 7개의 요인에 대한 JMP의 기본 설계는 23회 런입니다).
이렇게 말했지만 모든 요소가 중요하다는 것을 이미 알고 있으므로 이것은 실제로 선별 상황이 아닙니다. 대신 RSM 모델에 대한 맞춤형 설계를 설계할 수 있습니다.
이게 도움이 되길 바란다,
필
Re: 실험 설계커뮤니티에 오신 것을 환영합니다.
Phil의 질문에 추가:
1. 측정 시스템에 대해 공부해 보셨습니까?
2. 7가지 단백질이 중요한 영향을 미친다는 것을 어떻게 아십니까? 그들은 어떻게 연구되었으며 어떤 추론 공간에서 연구되었습니까?
3. 그것이 비선형인지 어떻게 알 수 있습니까? 대 이것은 당신이 가지고 있고 연구하고 싶은 가설입니까?
4. 출발 물질이 큰 영향을 미친다는 것을 알게 된다면, 앞으로 어떻게 대처하고 싶으신가요? 예를 들어, 그것에 강해지기를 원하십니까? 보상을 위해 프로세스를 조정하시겠습니까? 출발 물질을 개선하기 위해 노력하고 싶습니까?
Phil이 제안한 것처럼 적절한 디자인을 선택하기 전에 숙고하고 고려해야 할 사항이 많습니다. 그리고 정확히 올바른 디자인을 선택할 가능성은 거의 0에 가깝습니다(매우 경험이 많은 디자이너의 경우에도). "당신이 디자인할 최고의 디자인은 실험을 실행한 후에 디자인하는 디자인입니다." 따라서 순차적으로 생각하십시오. 첫 번째 실험은 더 나은 실험을 설계하기 위한 정보를 제공합니다. 반복 작업의 어느 시점에서든 여러 설계를 생성할 수 있습니다(JMP에서는 쉽게 수행할 수 있음). 각 디자인이 제공할 수 있는 지식과 실행 비용을 평가하십시오. 각각에 대해 가능한 모든 결과를 예상한 다음 하나를 선택하고 데이터를 수집하고 분석하고 반복합니다.
Re: 실험 설계제 질문에 답변해 주셔서 감사합니다.
약간의 맥락: 우리는 줄기 세포(우리의 출발 물질)를 사용하여 지방 세포로 분화(변환)하며 이러한 분화에는 7가지 단백질(사이토카인)이 필요합니다. 우리의 응답은 지방 세포의 백분율입니다.
1. 예, 측정 시스템이 검증되었습니다.
2. 이러한 단백질의 선택은 수년간의 연구에 의해 정당화되었으며 이러한 단백질은 이러한 차별화에 영향을 미치는 것으로 참고 문헌에 알려져 있습니다. 그러나 당신은 요점이 있습니다. 저는 이러한 종류의 연구(각 요인의 효과 평가)가 이전에 수행되지 않았기 때문에 모든 것이 중요하다고 100% 확신할 수 없다고 생각합니다.
3. 일부 사이토카인은 농도에 따라 선형 반응을 나타내지 않는 것으로 알려져 있습니다. 예를 들어, 농도의 증가는 응답에 부정적인 영향을 미칠 수 있습니다. 이것은 사이토카인 중 하나의 경우입니다.
4. 네, 최종적으로는 출발 물질을 통해 만족스러운 결과를 제공하는 사이토카인의 조합을 갖는 것이지만 일부 줄기 세포가 다른 줄기 세포보다 더 나은 수율을 갖도록 만드는 요인이 알려지지 않았기 때문에 프로세스를 조정할 수 없다고 생각합니다. 모든 경우에 적어도 55%의 지방 세포가 있기를 바랍니다.
Re: 실험 설계그것은 모두 알아두면 유용합니다. 감사해요, @에코카세 . 가능한 분석 수, 세포 물질 배치 및 배치당 분석 수에 대해 알려주실 수 있습니까? 이것은 중요할 것입니다.
Re: 실험 설계
예, 저는 할수 있습니다 @Phil_Kay ,
같은 날에 수행해야 하는 경우 설계당 18개의 분석이 기술적으로 수행할 수 있는 최대값입니다. 우리는 충분한 줄기 세포를 가지고 있지만 하나의 세포 배치만을 사용하여 70개의 분석을 수행하는 것은 불가능할 것입니다. 수행할 수 있는 분석의 평균 수는 약 30개입니다(세포 배치는 세포 수량 면에서 동일한 크기가 아닙니다).
Re: 실험 설계이 경우 단백질 인자 및 차단 인자에 대한 RSM 모델과 함께 맞춤형 디자인을 사용하여 세포 물질 배치를 관리할 수 있습니다. 총 몇 번의 실행을 원하는지, 보고 싶은 셀 재료 bxs의 수, 하루에 몇 개의 실행을 원하는지, 하루에 여러 셀 재료 bxs를 볼 수 있는지 여부 및 기타 실용적인 고려 사항에 따라 다릅니다. ...
Re: 실험 설계답변 주셔서 감사합니다. 셀 배치에 대해 여전히 몇 가지 질문이 있습니다. 사실상, 우리는 세포의 끝없는 배치를 가질 수 있습니다. 어떻게 생산 공정이 계속 작동하는지 확인할 수 있습니까?
Re: 실험 설계지금과 다른 방식으로 답변하겠습니다. @Phil_Kay 그리고 @statman 기술적인 질문, 답변 및 조언이 정확합니다. 주로 DOE에서 자칭 '초보자'이기 때문에 여력이 있다면 이 과정을 안내해 줄 컨설턴트를 고용하겠습니다. 1001개의 문제가 있고 제기될 것이며 Phil과 Statman은 이와 같은 간단한 포럼에서 표면을 긁었습니다. 예를 들어, 실험을 진행하는 동안 '계획'에 '잘못된' 일이 생긴다면? 또는 응답 측정? 그리고 거기에 도달하면 분석을 위해 새 스레드를 시작해야 합니다. 실시간으로 빠른 답변을 드리는 곳이 아닙니다. 바이오어세이 작업 경험이 있는 유능한 컨설턴트가 귀하와 함께 많은 문제를 탐색하고 귀하의 질문에 대한 안내를 제공할 수 있습니다.
Re: 실험 설계나는 다음과 같이 혼란스러워합니다.
"하지만 일부 줄기 세포가 다른 줄기 세포보다 더 나은 수율을 갖도록 만드는 요인이 알려지지 않았기 때문에 프로세스를 조정할 수 없다고 생각합니다." 그리고 관련:
"생산 공정이 계속 작동하는지 어떻게 확인할 수 있습니까?"
세포의 배치 간 변형이 있는 이유를 이해하려고 노력하지 않으시겠습니까?
실험을 시작하기 전에 변수의 어떤 구성 요소가 가장 큰 영향을 미치는지 파악하려고 노력할 수 있거나 시도해야 하는 것 같습니다. 변동의 원인이 가장 큰 것은 무엇입니까? 셀 배치 내부 또는 사이? 샘플링(변이 연구의 구성 요소, 계층적 또는 체계적)을 수행하여 여러 구성 요소의 일관성과 크기를 결정하고 이러한 구성 요소에 대해 측정 시스템을 평가할 수 있으며, 이는 실험에서 이러한 소스를 처리하는 방법을 결정하는 데 매우 유용합니다.
Re: 실험 설계Pete의 의견에 동의합니다... 우리가 할 수 있는 일은 OP가 실험 설계 과정에 대한 한계를 인식하여 필요한 조언을 구할 수 있도록 하는 것입니다.
나는 Easy DOE 플랫폼의 의도를 존중하지만 모순어법으로 보입니다.
Re: 실험 설계안녕하세요, 답변해 주셔서 감사합니다. 우리는 컨설턴트의 감독을 받을 계획입니다. 나는 단지 다른 관점을 갖고 싶습니다.
