實驗設計大家好,
首先,請原諒我的英語,因為我的母語不是英語。我是實驗設計領域的初學者,這就是我尋求見解的原因。我的問題如下:
1.我需要優化我們使用的細胞培養基所含的7種蛋白質的濃度
2.我們知道這7種蛋白質對反應(產量)都有顯著影響
3. 我們不知道蛋白質之間是否有交互作用
4. 我們知道某些蛋白質的效果與濃度不是線性的:這意味著比平常更高的濃度會對產量產生負面影響(可能是二次效應)
5. 我們也知道用作細胞培養起始材料的細胞對產量有很大影響,但由於我們無法控制該因素,因此我們正在考慮將其用作阻斷因子。
我的問題如下:
- 我們如何開始?我們是否評估我們制定的第一個計劃中的阻塞因素?
- 我們是否需要對每個因子使用三個水平(蛋白質濃度)還是兩個水平來減少檢測次數(但我們可能會錯過二次效應)
先感謝您。
消費者與市場研究實驗設計回复:實驗設計你好@Ekokase ,
我們可能無法涵蓋您在設計和執行實驗之前應該考慮的所有事項。 但我很樂意提供一些想法。
一些重要的問題:
您能夠進行多少次檢測?
你們有多少批次的細胞起始材料?
您可以從每批細胞起始材料中進行多少次檢測?
最終篩選設計可能是一個很好的起點。 這將提供一個相對較小的實驗(例如,JMP 的默認設計是 7 個因子、3 個區組和 3 個中心點是 23 次試驗)。
話雖如此,你已經知道所有因素都很重要,所以這並不是真正的篩選情況。 相反,您可能想要為 RSM 模型設計定制設計。
我希望這有幫助,
菲爾
回复:實驗設計歡迎來到社區。
添加到菲爾的問題:
1、你研究過測量系統嗎?
2. 你怎麼知道這7種蛋白質有顯著的作用? 他們是如何研究的以及在什麼推理空間下(研究時噪音(例如,起始材料)在做什麼?)
3. 你怎麼知道它是非線性的,而這是你想要研究的假設?
4. 如果你知道起始材料有巨大的影響,你想在未來如何處理? 例如,你想讓自己變得堅強嗎? 你想調整你的過程來補償嗎? 你想致力於改進起始材料嗎?
正如 Phil 所建議的,在選擇合適的設計之前,有很多事情需要考慮和考慮。 並且您選擇完全正確的設計的可能性接近於 0(即使對於非常有經驗的設計師也是如此)。 “你設計的最好的設計是你在運行實驗後設計的”。 所以想想順序。 第一個實驗將為設計更好的實驗提供信息。 在迭代的任何時候,創建多個設計(在 JMP 中很容易做到)。 評估每個設計可能提供的知識與運行它的成本。 預測每個可能的結果,然後選擇一個,獲取數據,分析和迭代。
回复:實驗設計感謝您抽出時間回答我的問題。
一些背景知識:我們使用乾細胞(我們的起始材料)並將它們分化(轉化)為脂肪細胞,而這 7 種蛋白質(細胞因子)是這種分化所必需的。 我們的反應是脂肪細胞的百分比。
1. 是的,測量系統已經過驗證。
2. 這些蛋白質的選擇經過多年的研究證明是合理的,並且在參考書目中已知這些蛋白質對這種分化有影響。 但你說得有道理,我認為我們不能 100% 確定所有這些都很重要,因為以前沒有進行過此類研究(評估每個因素的影響)。
3. 一些細胞因子被認為根據其濃度不具有線性反應。 例如,濃度的增加可能會對響應產生負面影響。 我們的一種細胞因子就是這種情況。
4. 是的,最終結果是通過起始材料獲得令人滿意的結果的細胞因子組合,但我不認為我們可以調整過程,因為尚不清楚是什麼使某些幹細胞比其他幹細胞具有更好的產量。 我們希望它在所有情況下至少有 55% 的脂肪細胞。
回复:實驗設計知道這些都是有用的。 謝謝, @Ekokase . 您能告訴我們可行的檢測數量、細胞材料批次和每批次的檢測嗎? 這很重要。
回复:實驗設計
我可以@Phil_凱,
如果必須在同一天進行,則每個設計 18 次測定是技術上可以完成的最大值。 我們有足夠的干細胞,但僅使用一批細胞進行 70 次檢測是不可能的,平均可以進行的檢測數量約為 30 次(細胞批次的細胞數量不同)。
回复:實驗設計在這種情況下,您可能希望將定制設計與蛋白質因子的 RSM 模型和區組因子一起使用,以管理細胞材料批次。 這實際上取決於您總共要運行多少次,要查看多少個細胞材料 bx,每天要運行多少次,是否可以每天查看多個細胞材料 bx,以及其他實際考慮因素...
回复:實驗設計謝謝您的回答。 我對細胞批次仍有一些疑問。 實際上,我們可以有無窮無盡的電池批次,我們如何確保生產過程仍然有效?
回复:實驗設計與之前相比,我將以不同的方式回复@Phil_凱和@statman他們的技術問題、答案和建議都很到位。 如果您有足夠的資金,主要是因為您自稱是 DOE 的“初學者”,我會聘請一名顧問來指導您完成此過程。 有 1001 個問題已經並將出現,Phil 和 Statman 只是在像這樣的緊湊型論壇中觸及了表面。 例如,如果在實驗過程中“計劃”出現“錯誤”怎麼辦? 或測量反應? 一旦你到達那裡,你將不得不開始一個新的線程進行分析。 這不是實時獲得快速答复的地方。 具有生物測定工作經驗的稱職顧問可以與您探討許多問題,並為您的問題提供指導。
回复:實驗設計我對以下內容感到困惑:
“但我不認為我們可以調整這個過程,因為尚不清楚是什麼讓一些幹細胞比其他幹細胞具有更好的產量”及相關:
“我們如何確保生產過程仍然有效”
您為什麼不嘗試了解為什麼細胞批次之間存在差異?
在我看來,您可以/應該在開始實驗之前嘗試弄清楚變異的哪些組成部分具有最大的影響力。 哪些變異來源最大? 在細胞批次內或批次之間? 您可以進行抽樣(變異研究的組成部分,分層的或系統的)以確定多個組成部分的一致性和大小(並根據這些組成部分評估您的測量系統),這對於確定如何在實驗中處理這些來源非常有幫助。
回复:實驗設計我同意皮特的觀點……我們所能做的就是讓 OP 認識到他們在設計實驗過程中的局限性,這樣他們就可以尋求他們需要的建議。
雖然我尊重 Easy DOE 平台的意圖,但在我看來這似乎是矛盾的。
回复:實驗設計您好,謝謝您的回答。 我們確實計劃由顧問監督。 我只是想有另一個觀點。