实验设计大家好,
首先,请原谅我的英语,因为我不是以英语为母语的人。我是实验设计领域的初学者,这就是我寻求见解的原因。我的问题如下:
1. 我需要优化我们使用的细胞培养基中所含的 7 种蛋白质的浓度
2. 我们知道这 7 种蛋白质对反应(产量)有显著影响
3. 我们不知道蛋白质之间是否存在相互作用
4. 我们知道,某些蛋白质的效果与浓度不是线性的:这意味着比平常更高的浓度会对产量产生负面影响(可能存在二次效应)
5. 我们还知道,作为细胞培养的起始材料所用的细胞对产量有很大的影响,但由于我们无法控制该因素,因此我们正在考虑将其用作阻断因子。
我的问题如下:
- 我们如何开始?我们在制定的第一个计划中是否评估了阻碍因素?
- 我们是否需要对每个因子(蛋白质浓度)使用三个水平或两个水平来减少检测次数(但我们可能会错过二次效应)
先感谢您。
消费者和市场研究实验设计回复:实验设计你好@Ekokase ,
我们可能无法涵盖您在设计和执行实验之前应该考虑的所有事项。 但我很乐意提供一些想法。
一些重要的问题:
您能够进行多少次检测?
你们有多少批次的细胞起始材料?
您可以从每批细胞起始材料中进行多少次检测?
最终筛选设计可能是一个很好的起点。 这将提供一个相对较小的实验(例如,JMP 的默认设计是 7 个因子、3 个区组和 3 个中心点是 23 次试验)。
话虽如此,你已经知道所有因素都很重要,所以这并不是真正的筛选情况。 相反,您可能想要为 RSM 模型设计定制设计。
我希望这有帮助,
菲尔
回复:实验设计欢迎来到社区。
添加到菲尔的问题:
1、你研究过测量系统吗?
2. 你怎么知道这7种蛋白质有显着的作用? 他们是如何研究的以及在什么推理空间下(研究时噪音(例如,起始材料)在做什么?)
3. 你怎么知道它是非线性的还是你有并且想要研究的假设?
4. 如果你知道起始材料有巨大的影响,你想在未来如何处理? 例如,你想让自己变得坚强吗? 你想调整你的过程来补偿吗? 你想致力于改进起始材料吗?
正如 Phil 所建议的,在选择合适的设计之前,有很多事情需要考虑和考虑。 并且您选择完全正确的设计的可能性接近于 0(即使对于非常有经验的设计师也是如此)。 “你设计的最好的设计是你在运行实验后设计的”。 所以想想顺序。 第一个实验将为设计更好的实验提供信息。 在迭代的任何时候,创建多个设计(在 JMP 中很容易做到)。 评估每个设计可能提供的知识与运行它的成本。 预测每个可能的结果,然后选择一个,获取数据,分析和迭代。
回复:实验设计感谢您抽出时间回答我的问题。
一些背景知识:我们使用干细胞(我们的起始材料)并将它们分化(转化)为脂肪细胞,而这 7 种蛋白质(细胞因子)是这种分化所必需的。 我们的反应是脂肪细胞的百分比。
1. 是的,测量系统已经过验证。
2. 这些蛋白质的选择经过多年的研究证明是合理的,并且在参考书目中已知这些蛋白质对这种分化有影响。 但你说得有道理,我认为我们不能 100% 确定所有这些都很重要,因为以前没有进行过此类研究(评估每个因素的影响)。
3. 一些细胞因子被认为根据其浓度不具有线性反应。 例如,浓度的增加可能会对响应产生负面影响。 我们的一种细胞因子就是这种情况。
4. 是的,最终结果是通过起始材料获得令人满意的结果的细胞因子组合,但我不认为我们可以调整过程,因为尚不清楚是什么使某些干细胞比其他干细胞具有更好的产量。 我们希望它在所有情况下至少有 55% 的脂肪细胞。
回复:实验设计知道这些都是有用的。 谢谢, @Ekokase . 您能告诉我们可行的检测数量、细胞材料批次和每批次的检测吗? 这很重要。
回复:实验设计
我可以@Phil_凯,
如果必须在同一天进行,则每个设计 18 次测定是技术上可以完成的最大值。 我们有足够的干细胞,但仅使用一批细胞进行 70 次检测是不可能的,平均可以进行的检测数量约为 30 次(细胞批次的细胞数量不同)。
回复:实验设计在这种情况下,您可能希望将定制设计与蛋白质因子的 RSM 模型和区组因子一起使用,以管理细胞材料批次。 这实际上取决于您总共要运行多少次,要查看多少个细胞材料 bx,每天要运行多少次,是否可以每天查看多个细胞材料 bx,以及其他实际考虑因素...
回复:实验设计谢谢您的回答。 我对细胞批次仍有一些疑问。 实际上,我们可以有无穷无尽的电池批次,我们如何确保生产过程仍然有效?
回复:实验设计与之前相比,我将以不同的方式回复@Phil_凯和@statman他们的技术问题、答案和建议都很到位。 如果您有足够的资金,主要是因为您自称是 DOE 的“初学者”,我会聘请一名顾问来指导您完成此过程。 有 1001 个问题已经并将出现,Phil 和 Statman 只是在像这样的紧凑型论坛中触及了表面。 例如,如果在实验过程中“计划”出现“错误”怎么办? 或测量反应? 一旦你到达那里,你将不得不开始一个新的线程进行分析。 这不是实时获得快速答复的地方。 具有生物测定工作经验的称职顾问可以与您探讨许多问题,并为您的问题提供指导。
回复:实验设计我对以下内容感到困惑:
“但我不认为我们可以调整这个过程,因为尚不清楚是什么让一些干细胞比其他干细胞具有更好的产量”及相关:
“我们如何确保生产过程仍然有效”
您为什么不尝试了解为什么细胞批次之间存在差异?
在我看来,您可以/应该在开始实验之前尝试弄清楚变异的哪些组成部分具有最大的影响力。 哪些变异来源最大? 在细胞批次内或批次之间? 您可以进行抽样(变异研究的组成部分,分层的或系统的)以确定多个组成部分的一致性和大小(并根据这些组成部分评估您的测量系统),这对于确定如何在实验中处理这些来源非常有帮助。
回复:实验设计我同意皮特的观点……我们所能做的就是让 OP 认识到他们在设计实验过程中的局限性,这样他们就可以寻求他们需要的建议。
虽然我尊重 Easy DOE 平台的意图,但在我看来这似乎是矛盾的。
回复:实验设计您好,谢谢您的回答。 我们确实计划由顾问监督。 我只是想有另一个观点。