Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésVous pourriez être intéressé par le Test personnalisé dans Ajuster le modèle (triangle rouge supérieur > Estimations > Test personnalisé), qui utilise la saisie manuelle des coefficients de contraste.
Il semble qu'une question similaire ait été posée et répondue il y a quelques années : https://community.jmp.com/t5/Discussions/How-to-specify-contrast-coefficients-with-quot-Contrast/td-p/337578. Vous voudrez peut-être revoir ce fil.
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésMerci d'avoir partagé ce fil. On dirait qu'à la fin de celui-ci, on pose la même question que je pose ici (comment réaliser un contraste avec un espacement inégal entre les traitements).
Lorsque vous utilisez l'outil de test personnalisé, les mêmes règles s'appliquent-elles en ce qui concerne additionnant jusqu'à 0 et valeur absolue inférieure à 2 ?
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésAucune règle de ce genre ne s'applique ici; pour chaque colonne du test personnalisé, vous pouvez tester/estimer tout contraste d'intérêt...
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésVous pouvez voir dans l'exemple qui apparaît dans l'autre discussion citée que JMP normalise automatiquement les coefficients utilisés pour calculer les contrastes.
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésMarquer,
Pouvez-vous expliquer ce que vous entendez par normalise les coefficients ?
Êtes-vous en train de dire que je peux plus ou moins ignorer le calcul des coefficients pour des traitements inégalement espacés et agir comme s'ils étaient régulièrement espacés ?
Merci pour votre aide!
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésUtilisez le lien dans la première réponse de Ross pour voir la discussion précédente. Regardez la première image, Tableau A.2. Mon exemple est pour le cas où V = 4. J'ai saisi les coefficients de contraste -3, -1, +1 et +3 du tableau A.2 à l'aide des boutons + et - de l'interface JMP. Les résultats Contraste > Détail du test dans la capture d'écran sous le tableau A.2 montrent que JMP a utilisé les coefficients de contraste linéaires de 0,75, 0,25, -0,25 et -0,75. Remarque dans la discussion d'origine, j'ai entré les coefficients dans l'ordre inverse par erreur. Les détails du test auraient affiché -0,75, -0,25, 0,25 et 0,75 si je les avais correctement saisis.
Je ne sais pas ce que vous entendez par "même espacés". Ce n'est pas une exigence pour l'analyse de la variance. Les niveaux sont modélisés sous forme de valeurs nominales et les tests portent sur des moyennes de groupe ou des combinaisons de moyennes de groupe.
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacés
Je suis d'accord que les coefficients de contraste que vous avez attribués de -0,75, -0,25, 0,25 et 0,75 seraient corrects si les traitements étaient 0, 50, 100, 150 (équidistants). Parce que le dernier traitement est en fait 200, c'est ce que je veux dire par espacement inégal.
Je suis intéressé de voir si les réponses ont une tendance linéaire, quadratique ou cubique, pas seulement en comparant les moyennes d'un groupe de traitement à un autre groupe de traitement. Voici le lien pour calculer l'analyse de tendance pour des intervalles inégaux pour l'ANOVA unidirectionnelle : https://real-statistics.com/one-way-analysis-of-variance-anova/trend-analysis-polynomial-contrast-coefficients/trend-analysis-unequal-intervals/
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésNe pas connaître les détails de votre expérience rend cela difficile, mais pouvez-vous traiter la dose comme un facteur continu et la modéliser via ANCOVA ?Oui, vous n'avez que 4 niveaux (0, 1, 2, 4) mais ce n'est peut-être pas une mauvaise façon de visualiser au moins ce qui se passe.
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacés@thayermo07 , voici comment vous le faites via Custom Test (j'ai un lot où vous aurez la dose).
Commencez par effectuer un test personnalisé pour trouver les coefficients dont vous avez besoin dans la boîte de dialogue Test personnalisé.Vous dites que vous avez besoin de ce contraste : 224, -128, -256, 160.
Ok, alors mettez-les dans quatre colonnes dans le test personnalisé comme celui-ci. Le lot D est ainsi en raison de la façon dont le modèle (via la plateforme Fit Model) est paramétré.
Ajoutez ensuite les colonnes pour obtenir ce qui suit.
Puis, enfin, faites un autre test personnalisé pour obtenir votre contraste final qui vous intéresse. c'est-à-dire que le contraste indiqué ci-dessous est le contraste quadratique souhaité. Il est important de comprendre comment le modèle (via la plateforme Ajuster le modèle) est paramétré pour utiliser correctement la boîte de dialogue Test personnalisé.
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésC'est un peu déroutant pour moi. Cela vous dérangerait-il de partager un lien vers du matériel expliquant cela ? À première vue, pourquoi la colonne 5 est-elle 160, puis négative 160 pour les cellules en dessous ?
Merci pour votre aide!
Re : Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésOui, cela peut prêter à confusion.C'est ainsi que le modèle est paramétré. Oui, ça a l'air drôle... mais une fois que vous réalisez comment le modèle est paramétré, c'est juste un ajout pour obtenir les contrastes/comparaisons/estimations/etc. d'intérêt.
Voici quelques détails : https://www.jmp.com/support/help/en/17.1/index.shtml#page/jmp/nominal-factors.shtml#ww65535 .
Maintenant, vous pouvez également voir un autre paramétrage si vous regardez les résultats du "paramétrage de la fonction d'indicateur" dans la plate-forme Fit Model (comparez-les aux "estimations des paramètres"). Ils semblent différents, mais ils sont équivalents. Cela, cependant, ne changera pas le paramétrage dans la boîte de dialogue Test personnalisé. Je prendrais un peu de temps pour examiner vos estimations de paramètres pour m'assurer que vous les comprenez, ainsi que leurs valeurs p respectives (c'est-à-dire quelles sont les hypothèses nulles). Une façon d'aider est de sélectionner "Afficher l'expression de prédiction" pour voir à quoi ressemble réellement le modèle.
Contrastes linéaires et quadratiques avec des traitements inégalement espacésJ'utilise la fenêtre de spécification des contrastes avec les boutons + et -. Cependant, lorsque les traitements sont inégalement espacés, le simple + et - ne fonctionne pas. Voici mon exemple précis :
Doses de traitement : 0, 1, 2, 4
Ces doses ne sont PAS espacées de manière égale, nous ne pouvons donc pas utiliser les contrastes linéaires et quadratiques typiques à 4 niveaux. J'ai calculé les coefficients appropriés comme le montre ce lien.
https://real-statistics.com/one-way-analysis-of-variance-anova/trend-analysis-polynomial-contrast-coefficients/trend-analysis-unequal-intervals/
D'après mes calculs, les coefficients linéaires devraient être -7, -3, 1, 9. Dans JMP, -0.7, -0.3, 0.1 et 0.9 satisfont aux exigences JMP d'addition jusqu'à 0 et de valeur absolue inférieure à 2.
Mon problème est avec les coefficients quadratiques. D'après mes calculs, les coefficients quadratiques devraient être 224, -128, -256, 160. Comment puis-je obtenir ces coefficients quadratiques dans JMP 16 Pro ?
Merci pour tous les conseils !!
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