RNAseq 数据标准化JMP Genomics 有一些针对 RNAseq 数据的标准化方法，包括 KDMM、RPM 缩放、TMM、TPM 和上四分位数缩放。 JMP Pro 17 缺少如此重要的工具。
RNAseq 或其他大规模数据（例如代谢组学）标准化方法的目的是减少系统实验偏差和技术变异。 由于数据未标准化，稿件可能会被期刊拒绝。 RNAseq 最常用的标准化方法是“每百万映射读数中每千碱基转录本的读数”(RPKM)（莫尔塔扎维等人， 2008年； doi：10.1038/nmeth.1226 ) 和 M 值的截尾平均值 (TMM) (罗宾逊和奥什拉克； doi：10.1186/gb-2010-11-3-r25）。
我的愿望是将标准化方法纳入 JMP Pro
基础数据分析和建模回复：RNAseq 数据标准化 - 状态更改为：正在调查@Marina_N谢谢你的反馈。我们正在考虑将来为基因组数据添加一些额外的标准化工具。
