JMP Genomics에는 KDMM, RPM 스케일링, TMM, TPM 및 상위 사분위수 스케일링을 포함하여 RNAseq 데이터에 대한 몇 가지 정규화 방법이 있습니다. JMP Pro 17에는 이러한 중요한 도구가 없습니다.
RNAseq 또는 대사체학과 같은 기타 대규모 데이터에 대한 정규화 방법의 목적은 체계적인 실험 편향과 기술적 편차를 줄이는 것입니다. 데이터가 정규화되지 않았기 때문에 저널에서 원고를 거부할 수 있습니다. RNAseq에 가장 일반적으로 사용되는 정규화 방법은 "Reads Per Kilobase of transcripts per Million mapped reads"(RPKM)입니다. 모르타자비 등, 2008년; 도이: 10.1038/nmeth.1226 ) 및 절사된 M-값 평균(TMM)( 로빈슨과 오슬랙; 도이: 10.1186/gb-2010-11-3-r25).
JMP Pro에 정규화 방법을 포함하고 싶습니다.
