是什么激发了这个愿望清单请求? 请描述当前需要改进的问题,或者目前不容易或不可能解决的新问题。
允许其他 RNA-seq 标准化方法,例如 TMM、RPKM、TPM、KDMM、比率中值
请描述您希望看到的新的或改进的功能或解决方案。
如果提供此新功能,对您和/或其他用户有何价值? 任何有关易用性、节省时间、新功能价值的信息将不胜感激。 如果您可以通过其他软件解决方案获得此功能,请描述该软件工具。
提供用于 RNA-seq 数据的常见转换/标准化方法,以帮助分析该数据。
从“列”菜单或右键单击“新建列公式”,提供包含这些的转换选项。 输出不应在列中包含列公式(这些方法适用于 100 个样本/行中的 10,000 个列)
这是外部客户的请求吗? 如果是,请提供客户帐户名称、主要联系人以及提出请求的用户。
是的,USDA-ARS,但在使用此类数据的其他人中也很常见。曾在 JMP Genomics 工作。 还有康奈尔大学和嘉吉大学
是否有具有我们应该注意的此功能或解决方案的竞争软件包? 请提供有关竞争性软件的任何信息,包括网站链接、演示或示例。
R/Bioconductor 其他基因表达分析工具(GeneSpring、Omic Soft 等)
这是否会影响客户的续订、扩展或采用?如果我们不解决这个问题,是否会导致帐户面临风险? 请提供帐户具体问题的合理详细信息和描述。
不确定,但它可能会阻止小型组织的新销售,这些组织没有可以为客户生成这些数据的生物信息学部门。
@克里斯_基希伯格- 谢谢你的建议! 我们已收到您的请求并将予以考虑。