Hallo zusammen, da mein Praktikum am 4. April zu Ende geht, wollte ich nur einen Beitrag über meine Erfahrungen bei JMP und die Arbeit schreiben, die ich zusammengestellt habe.
Zunächst möchte ich mich bei allen von JMP bedanken, mit denen ich interagiert habe. Alle waren äußerst freundlich und ich habe mich vom ersten Tag an sehr willkommen gefühlt. Ein großes Dankeschön an @volker_kraft und @Phil_Kay für ihre Anleitung und Betreuung in den letzten Monaten und für die Duldung meiner (vielen) Fragen!
Meine Ziele
Während meines Praktikums hatte ich die Aufgabe, mich mit der Functional Data Explorer-Plattform vertraut zu machen und wertschöpfende Fallstudien für Demos und akademische Fallstudien, insbesondere im Bereich Biotechnologie, zu entwickeln. Mein Ziel war es, wertvolle Ressourcen zu schaffen, die das Interesse von Wissenschaftlern wecken und ihnen auch bei der Bildung helfen würden, sowie Demonstrationen und Social-Media-Beiträge über meine LinkedIn-Serie #FunctionalBio zu erstellen.
Fallstudien finden
Die größte Herausforderung bei der Erstellung der Fallstudien bestand darin , die Daten zu finden – trotz der unzähligen Veröffentlichungen zu Funktionsdaten in den vorgelagerten und analytischen Bereichen der Biotechnologie veröffentlichte niemand seinen vollständigen Datensatz. Ich habe eine Liste nützlicher Datenrepositorys zusammengestellt, die ich gefunden habe (im Anhang), um bei der Datensuche zu helfen, sowohl universitätsgebundene als auch nicht-angegliederte.
Die Fallstudien
In den letzten 3 Monaten habe ich die folgenden Fallstudien zusammengestellt:
Funktionelles DOE mit HPLC-Trennung
Basierend auf meiner eigenen Doktorarbeit und Erfahrung in der Chromatographie nutzt dieses Beispiel die „typische“ Methode der Einzelausgangsmessung mit HPLC (Peakhöhe, -breite und -zeit) und fügt alles in einem einfach zu lesenden Profiler zusammen, der die experimentellen Ergebnisse verbessert .
Studie zu Bioreaktordaten
Ich hatte den Schmerz gespürt, mehr als 12 Bioreaktoren auf einmal zu betreiben und viele Tage lang Messwerte für mehr als 10 Sensoren zu erhalten, und dachte : „Wie soll ich das verstehen?“ Ich war sehr daran interessiert, einen Bioreaktor-Datensatz (mit DOE) zu finden, mit dem ich die Verwendung von FDE demonstrieren konnte. Dieses Beispiel (von der University of Edinburgh) zeigt gut, wie Sie alle Sensordaten, die Sie während eines Laufs passiv sammeln, analysieren und sie verwenden können, um zu verstehen, was ein „guter“ und ein „schlechter“ Lauf ist. Wenn ich dies Upstream-Wissenschaftlern vorführe, scheinen sie immer begeistert zu sein!
Zellwachstum mit Fit-Kurve
Nachdem ich diesen Datensatz in einem Datenrepository gefunden hatte, erstellte ich eine einfache Demonstration, die zeigt, wie die Fit Curve-Plattform zur Profilierung des Zellwachstums verwendet werden kann. Jeder Biologe hat schon einmal eine Zellwachstumskurve erstellt – mit dem Tool „Kurve anpassen“ wird die Analyse schneller, einfacher und effektiver, wenn Sie versuchen, die besten Bedingungen für Ihr Zellwachstum zu finden.
Akademische Fallstudien
Ich habe auch zwei akademische Fallstudien vorbereitet, die sich mit der Verwendung von FDE für HPLC und der Fit Curve-Plattform zur Analyse des Zellwachstums befassen – es war eine tolle Erfahrung, Lehrunterlagen zu erstellen und eine interessante Herausforderung bei dem Versuch, die Sprache umfassend und einfach zu verstehen zu halten I'm Verständnis.
Demos und Workshops – Ich hatte das Glück, meine Fallstudien mehreren Biotech- und Biopharmaunternehmen vorzuführen, die ihre Fähigkeiten in der Upstream- und Analyseentwicklung erweitern möchten, darunter Croda, Astrazeneca, Dr Reddy's Laboratories, Biomarin Pharmaceuticals und Fujifilm Diosynth Biotechnologies. Es war unglaublich nützlich zu lernen, wie man Kunden einen Mehrwert bietet und eine Sprache verwendet, die für jeden leicht verständlich ist, und ich habe diese Fähigkeiten in meine eigene Doktorarbeit übernommen.
Ich war auch an der Vorbereitung des Lehrmaterials für den Functional Data Explorer-Workshop am 3. März in London beteiligt – es war großartig, dabei mitzuwirken und dabei zu helfen, Kunden die FDE-Plattform näherzubringen!
Meine Zeit bei JMP war von unschätzbarem Wert und ich habe viele Fähigkeiten erlernt, die ich in meine zukünftige Karriere mitnehmen werde. Ich hoffe, dass ich mich weiterhin in der JMP-Community engagieren und die Software und alle ihre Einsatzmöglichkeiten fördern kann!
Prost!
Ben
Hallo @Bingh94 ,
Ich kann nur ein großes „Dankeschön“ erwidern! für all deinen Einsatz, deine Neugier und deine Beiträge während deines Praktikums. Unsere Freitagstreffen mit @Phil_Kay waren für mich immer ein Highlight und eine hervorragende Lernmöglichkeit.
Wir sehen uns an der University of Manchester und vielleicht in Zukunft wieder bei JMP.
DANKE SCHÖN!
Volker
Hallo Ben,
Ich wünsche Ihnen alles Gute für Ihre zukünftigen Unternehmungen! Vielen Dank für die Fallstudien, das sind wirklich tolle Sachen! Vielleicht dürfen wir Sie eines Tages wieder bei uns begrüßen, ich bin mir sicher, dass Sie dafür kein separates Referenzschreiben benötigen 
Die chromatographische Auflösung kann oft ein herausfordernder Prozess bei der Entwicklung analytischer Methoden sein und hat große praktische und regulatorische Bedeutung (USP <621>-Chromatographie), insbesondere in der Pharmaindustrie. Probleme mit der chromatographischen Auflösung können komplex und vielfältig sein und unter anderem überlappende Peaks, Tailing-Peaks, Geisterpeaks, Basisliniendrift, schlechte Empfindlichkeit, Säulenüberladung, schlechte Probenvorbereitung und Säulendegradation umfassen.
Um das Problem der Peakauflösung zu lösen, ist ein gewisses Maß an Fachwissen erforderlich, das sowohl für Anfänger als auch für Profis oft eine Herausforderung darstellt, da es wichtig ist, die geeignete Säule und mobile Phase sorgfältig auszuwählen und die Flussrate zu optimieren. Ich fand diesen Anwendungsfall sowohl praktisch als auch zwingend für FDE und JMP Pro.
Danke, dass du deine Studien teilst, Ben!
Beste Wünsche!
Peng
Ben, es war mir eine Freude, dich zu haben! Sie haben eine Menge Ressourcen zusammengestellt und Ihre Arbeit hat viel dazu beigetragen, den Menschen mehr JMP Pro zugänglich zu machen!
Ein großes Dankeschön, @Bingh94 !
Florian
Hallo Ben, vielen Dank für Ihre interessante und praktische Fallstudienarbeit und dafür, dass Sie sich die Zeit genommen haben, eine organisierte Zusammenfassung mit Referenzen zu teilen!
Hallo Ben, die von Ihnen entwickelten akademischen Fallstudien werden eine wertvolle Ressource für die Fakultät sein.Vielen Dank für Ihre Beiträge und die besten Wünsche.Curt
Viel Glück für Ihre Zukunft!
Hallo Ben,
Vielen Dank für die tolle Arbeit und die Fallstudien, die Sie entwickelt haben.Herausragende Arbeit!Vielen Dank auch für die Informationen zu den Datenrepositorys. Neue Datenquellen können von unschätzbarem Wert sein.
Viel Glück bei Ihren zukünftigen Unternehmungen!
Beste grüße,
Rechnung
