인턴십 요약: Ben Ingham

안녕하세요 여러분. 제 인턴십이 4월 4 일 에 종료됩니다. JMP에서의 경험과 제가 진행한 작업에 대한 게시물을 작성하고 싶었습니다.
먼저, 저와 교류했던 JMP의 모든 분들께 감사의 말씀을 전하고 싶었습니다. 모두가 매우 친절했고 첫날부터 매우 환영받는 느낌을 받았습니다. 지난 몇 달 동안 지도와 감독을 해주고 (많은) 질문을 들어준 @volker_kraft 와 @Phil_Kay 에게 큰 감사를 드립니다!
내 목표
인턴십 기간 동안 저는 Functional Data Explorer 플랫폼에 익숙해지고 특히 생명공학 분야의 데모 및 학술 사례 연구를 위한 부가가치 사례 연구를 개발하는 임무를 맡았습니다. 내 목표는 과학자의 관심을 끌고 교육에도 도움이 되는 귀중한 리소스를 만드는 것뿐 아니라 LinkedIn 시리즈 #FunctionalBio를 통해 데모와 소셜 미디어 게시물을 만드는 것이었습니다.
사례 연구 찾기
사례 연구를 수행할 때 가장 큰 과제는 데이터를 찾는 것이 었습니다. 생명공학의 업스트림 및 분석 영역에서 기능적 데이터에 대한 셀 수 없이 많은 출판물이 있었음에도 불구하고 아무도 전체 데이터 세트를 공개하지 않았습니다. 대학 산하, 비산하 모두 데이터 검색에 도움이 되도록 제가 찾은(첨부) 유용한 데이터 저장소 목록을 정리했습니다.
사례 연구
지난 3개월 동안 저는 다음과 같은 사례 연구를 정리했습니다.
HPLC 분리 기능성 DOE
나의 박사 학위 연구와 크로마토그래피 경험을 바탕으로 이 예에서는 HPLC(피크 높이, 너비 및 시간)를 사용한 단일 출력 측정의 '일반적인' 방법을 사용하고 이를 모두 읽기 쉬운 프로파일러로 통합하여 실험 결과를 향상시킵니다. .
생물반응기 데이터 연구
12개 이상의 생물반응기를 한 번에 실행하고 10개가 넘는 센서에 대한 며칠 분량의 판독값을 수신하며 '이것을 어떻게 이해해야 할까요?'라고 생각하는 고통을 느꼈습니다. 저는 FDE의 사용을 입증할 수 있는 생물반응기 데이터 세트(DOE 사용)를 찾고 싶었습니다. 이 예(에든버러 대학교)는 달리는 동안 수동적으로 수집하는 모든 센서 데이터를 분석하고 이를 사용하여 '좋은' 달리기와 '나쁜' 달리기가 무엇인지 이해하는 방법을 훌륭하게 보여줍니다. 내가 이것을 상류 과학자들에게 시연했을 때 그들은 항상 흥분해 보였습니다!
맞춤 곡선을 사용한 세포 성장
데이터 저장소에서 이 데이터 세트를 찾은 후 Fit Curve 플랫폼을 사용하여 세포 성장을 프로파일링하는 방법을 보여주는 간단한 데모를 설정했습니다. 모든 생물학자는 세포 성장 곡선을 수행한 적이 있습니다. 세포 성장에 가장 적합한 조건을 찾으려고 할 때 Fit Curve 도구를 사용하면 분석이 더 빠르고 간단하며 더 효과적입니다.
학술 사례 연구
또한 저는 HPLC용 FDE 사용과 세포 성장 분석을 위한 Fit Curve 플랫폼을 다루는 두 가지 학술 사례 연구를 준비했습니다. 교육 문서를 준비하는 것은 훌륭한 경험이었고 언어를 포괄적이고 지원하기 쉽게 유지하려는 흥미로운 도전이었습니다. 이해에.
데모 및 워크숍 - 저는 운이 좋게도 Croda, Astrazeneca, Dr Reddy's Laboratories, Biomarin Pharmaceuticals 및 Fujifilm Diosynth Biotechnologies를 포함하여 업스트림 및 분석 개발 역량을 확장하려는 여러 생명공학 및 바이오제약 회사에 사례 연구를 시연할 수 있었습니다. 고객에게 가치를 입증하는 방법과 모든 사람이 쉽게 이해할 수 있는 언어를 사용하는 방법을 배우는 것은 매우 유용했으며 이러한 기술을 박사 과정 연구에 적용했습니다.
저는 또한 3월 3일 런던에서 열린 Functional Data Explorer 워크샵을 위한 교육 자료 준비에도 참여했습니다. 이 작업에 참여하고 고객에게 FDE 플랫폼을 가르치는 데 도움을 줄 수 있어서 좋았습니다!
JMP에서 보낸 시간은 매우 소중했으며 앞으로의 경력에 활용하게 될 많은 기술을 배웠습니다. 저는 계속해서 JMP 커뮤니티에 참여하여 소프트웨어와 그 모든 용도를 홍보하고 싶습니다!
건배!
벤
특집 기사답장: 인턴십 요약: Ben Ingham안녕 @Bingh94 ,
나는 단지 큰 "감사합니다!"라고 답할 수 있습니다. 인턴쉽 기간 동안 귀하의 모든 노력, 호기심 및 기여에 감사드립니다. 우리의 금요일 모임은 @Phil_Kay 그것은 항상 나에게 하이라이트이자 훌륭한 학습 기회였습니다.
맨체스터 대학교에서 뵙겠습니다. 나중에 JMP에서 다시 뵙겠습니다.
감사합니다!
볼커
답장: 인턴십 요약: Ben Ingham안녕하세요 벤,
미래의 노력에 최선을 다하길 바랍니다! 사례 연구를 진행해 주셔서 감사합니다. 정말 훌륭한 자료입니다! 언젠가 우리가 다시 당신을 환영할 수 있기를 바랍니다. 별도의 추천서가 필요하지 않을 것입니다 
답장: 인턴십 요약: Ben Ingham크로마토그래피 분해능은 분석법 개발에서 종종 어려운 프로세스일 수 있으며, 특히 의약품 분야에서 실용적이고 규제적인 중요성(USP <621> 크로마토그래피)이 많습니다. 크로마토그래피 분리능 문제는 피크 중첩, 테일링 피크, 고스트 피크, 기준선 드리프트, 감도 불량, 컬럼 과부하, 시료 준비 불량, 컬럼 품질 저하 등을 포함하여 복잡하고 다양할 수 있습니다.
피크 분리 문제를 해결하려면 상당한 수준의 전문 지식이 필요합니다. 이는 적절한 컬럼과 이동상을 신중하게 선택하고 유속을 최적화하는 것이 중요하기 때문에 초보자와 전문가 모두에게 종종 어려운 일입니다. 이 사용 사례는 FDE와 JMP Pro에 실용적이면서 강박적인 것으로 나타났습니다.
답장: 인턴십 요약: Ben Ingham연구 결과를 공유해 주셔서 감사합니다, Ben!
최고의 소원!
펭
답장: 인턴십 요약: Ben Ingham벤, 당신을 만나서 반가웠어요! 귀하는 훌륭한 리소스를 모아 사람들에게 더 많은 JMP Pro를 제공하는 데 많은 기여를 했습니다!
정말 감사합니다. @Bingh94 !
플로리안
답장: 인턴십 요약: Ben Ingham안녕하세요 벤, 흥미롭고 실용적인 사례 연구 작업과 시간을 내어 참고 자료와 함께 정리된 요약을 공유해 주셔서 감사합니다!
답장: 인턴십 요약: Ben Ingham안녕하세요 벤, 귀하가 개발한 학술 사례 연구는 교수진에게 귀중한 자원이 될 것입니다.귀하의 기여에 감사드리며 행운을 기원합니다.무뚝뚝한
답장: 인턴십 요약: Ben Ingham당신의 미래에 행운이 있기를 바랍니다!
답장: 인턴십 요약: Ben Ingham안녕하세요 벤,
귀하가 개발한 훌륭한 작업과 사례 연구에 감사드립니다.뛰어난 작품!데이터 저장소에 대한 정보도 알려주셔서 감사합니다. 새로운 데이터 소스는 매우 중요할 수 있습니다.
앞으로의 노력에 행운을 빕니다!
친애하는,
청구서