Bonjour à tous, alors que mon stage se termine le 4 avril, je voulais juste écrire un article sur mes expériences chez JMP et le travail que j'ai accompli.
Tout d'abord, je voulais remercier tous ceux de JMP avec qui j'ai interagi ; tout le monde a été extrêmement sympathique et je me suis senti très bien accueilli dès le premier jour. Un grand merci à @volker_kraft et @Phil_Kay pour leurs conseils et leur supervision au cours des derniers mois et pour avoir toléré mes (nombreuses) questions !
Mes objectifs
Au cours de mon stage, j'avais pour mission de me familiariser avec la plateforme Functional Data Explorer et de développer des études de cas à valeur ajoutée pour des démos et des études de cas académiques, notamment dans le domaine des biotechnologies. Mes objectifs étaient de créer des ressources précieuses qui susciteraient l'intérêt des scientifiques et les aideraient également à les éduquer, ainsi que de créer des démonstrations et des publications sur les réseaux sociaux via ma série LinkedIn #FunctionalBio.
Trouver des études de cas
Le plus grand défi lors de la réalisation des études de cas a été de trouver les données : malgré le nombre incalculable de publications sur les données fonctionnelles dans les domaines amont et analytiques de la biotechnologie , personne n'a publié l'ensemble de leurs données. J'ai dressé une liste de référentiels de données utiles que j'ai trouvés (ci-joint) pour faciliter la recherche de données, qu'elles soient affiliées ou non à une université.
Les études de cas
Au cours des 3 derniers mois, j'ai rassemblé les études de cas suivantes :
DOE fonctionnel de séparation HPLC
Basé sur mes propres recherches de doctorat et mon expérience en chromatographie, cet exemple prend la méthode « typique » de mesure de sortie unique avec HPLC (hauteur, largeur et temps du pic) et rassemble le tout dans un profileur facile à lire qui améliore les résultats expérimentaux. .
Etude des données du bioréacteur
Après avoir ressenti la douleur de faire fonctionner plus de 12 bioréacteurs en une seule fois et de recevoir plusieurs jours de lectures pour plus de 10 capteurs et de penser « Comment vais-je comprendre cela ? » J'avais très envie de trouver un ensemble de données sur les bioréacteurs (utilisant le DOE) qui me permettrait de démontrer l'utilisation du FDE. Cet exemple (de l'Université d'Édimbourg) montre bien comment vous pouvez analyser toutes les données de capteur que vous collectez passivement pendant une analyse et les utiliser pour comprendre ce qu'est une « bonne » et une « mauvaise » analyse. Lorsque j'en ai fait la démonstration aux scientifiques en amont, ils semblent toujours excités !
Croissance cellulaire avec courbe d'ajustement
Après avoir trouvé cet ensemble de données dans un référentiel de données, j'ai mis en place une démonstration simple qui montre comment la plateforme Fit Curve peut être utilisée pour profiler la croissance cellulaire. Chaque biologiste a, à un moment donné, réalisé une courbe de croissance cellulaire. En utilisant l'outil Fit Curve, l'analyse devient plus rapide, plus simple et plus efficace lorsque vous essayez de trouver les meilleures conditions pour votre croissance cellulaire.
Études de cas académiques
J'ai également préparé deux études de cas académiques couvrant l'utilisation du FDE pour la HPLC et de la plateforme Fit Curve pour analyser la croissance cellulaire. Ce fut une expérience formidable de préparer des documents pédagogiques et un défi intéressant pour essayer de garder un langage inclusif et simple à utiliser. dans la compréhension.
Démonstrations et ateliers - J'ai eu la chance de présenter mes études de cas à plusieurs sociétés de biotechnologie et biopharmaceutiques qui cherchent à étendre leurs capacités en matière de développement en amont et analytique, notamment Croda, Astrazeneca, Dr Reddy's Laboratories, Biomarin Pharmaceuticals et Fujifilm Diosynth Biotechnologies. Apprendre à démontrer de la valeur aux clients et à utiliser un langage facilement compréhensible par tout le monde a été incroyablement utile et j'ai intégré ces compétences dans mes propres recherches de doctorat.
J'ai également participé à la préparation du matériel pédagogique pour l'atelier Functional Data Explorer à Londres le 3 mars. C'était formidable de m'impliquer dans cela et d'aider à enseigner la plateforme FDE aux clients !
Mon séjour chez JMP a été inestimable et j'ai acquis de nombreuses compétences que j'utiliserai dans ma future carrière. J'espère continuer à m'impliquer dans la communauté JMP et à promouvoir le logiciel et toutes ses utilisations !
Acclamations!
Ben
Salut @Bingh94 ,
Je ne peux que vous répondre un grand "merci !" pour tous vos efforts, votre curiosité et vos contributions lors de votre stage. Nos rencontres du vendredi avec @Phil_Kay ont toujours été pour moi un moment fort et une excellente opportunité d’apprentissage.
Rendez-vous à l'Université de Manchester, et peut-être à nouveau chez JMP à l'avenir.
MERCI!
Volker
Salut Ben,
je vous souhaite tout le meilleur pour vos projets futurs! Merci beaucoup pour les études de cas, ce sont vraiment des trucs géniaux ! Puissions-nous une fois vous accueillir à nouveau, je suis sûr que vous n'aurez pas besoin d'une lettre de référence distincte 
La résolution chromatographique peut souvent constituer un processus difficile dans le développement de méthodes analytiques et revêt une grande importance pratique et réglementaire (chromatographie USP <621>), en particulier dans le secteur pharmaceutique. Les problèmes de résolution chromatographique peuvent être complexes et variés, notamment les pics qui se chevauchent, les pics résiduels, les pics fantômes, la dérive de la ligne de base, une faible sensibilité, la surcharge des colonnes, une mauvaise préparation des échantillons et la dégradation des colonnes, entre autres.
Un certain degré d'expertise est requis pour résoudre le problème de résolution des pics, qui est souvent intimidant pour les débutants comme pour les professionnels, car il est important de sélectionner soigneusement la colonne et la phase mobile appropriées et d'optimiser le débit. J'ai trouvé ce cas d'utilisation à la fois pratique et compulsif pour FDE et JMP Pro.
Merci d'avoir partagé vos études, Ben !
Meilleurs vœux!
Peng
Ben, ce fut un plaisir de t'avoir ! Vous avez rassemblé un grand nombre de ressources et votre travail a beaucoup contribué à faire connaître davantage de JMP Pro au grand public !
Un grand merci, @Bingh94 !
Florian
Bonjour Ben, Merci pour votre travail d'étude de cas intéressant et pratique, et pour avoir pris le temps de partager un résumé organisé avec des références !
Bonjour Ben, les études de cas académiques que vous avez développées seront une ressource précieuse pour les professeurs.Merci pour vos contributions et meilleurs vœux.Sec
Bonne chance dans votre avenir !
Bonjour ben,
Merci pour l'excellent travail et les études de cas que vous avez développés.Travail exceptionnel!Merci également pour les informations sur les référentiels de données. Les nouvelles sources de données peuvent être inestimables.
Bonne chance dans vos projets futurs !
Cordialement,
Facture
