皆さん、こんにちは。私のインターンシップは 4 月 4日に終わりに近づいているので、JMP での経験と私がまとめた仕事について記事を書きたいと思いました。
まず最初に、これまで関わってきた JMP の皆さんに感謝の意を表したいと思います。皆さんとてもフレンドリーで、初日からとても歓迎されていると感じました。過去数か月間、指導と監督をしていただき、私の (多くの) 質問に快く応じてくださった@volker_kraftと@Phil_Kayにとても感謝しています。
私の目標
インターンシップ中に、私は Functional Data Explorer プラットフォームに精通し、特にバイオテクノロジーの分野で、デモ用の付加価値のあるケース スタディや学術的なケース スタディを開発するという任務を負っていました。私の目標は、科学者の興味を引き、教育にも役立つ貴重なリソースを作成し、LinkedIn シリーズ #FunctionalBio を通じてデモンストレーションやソーシャル メディアへの投稿を作成することでした。
事例を探す
ケーススタディを作成する際の最大の課題は、データを見つけることでした。バイオテクノロジーの上流および分析分野における機能データに関する出版物は無数にあるにもかかわらず、完全なデータセットを公開する人は誰もいませんでした。大学関連と非関連のデータ検索に役立つ、私が見つけた便利なデータ リポジトリのリストをまとめました (添付)。
ケーススタディ
過去 3 か月間、私は次のようなケーススタディをまとめてきました。
HPLC 分離機能 DOE
私自身の博士課程の研究とクロマトグラフィーの経験に基づいて、この例では、HPLC による単一出力測定 (ピークの高さ、幅、時間) の「典型的な」方法を採用し、実験結果を向上させる読みやすいプロファイラーにすべてまとめています。 。
バイオリアクターのデータ研究
12 台以上のバイオリアクターを一度に実行し、10 個を超えるセンサーについて何日もかかる読み取り値を受け取り、 「どうやってこれを理解すればよいのか?」と考えるのは苦痛です。私は、FDE の使用を実証できるバイオリアクター データセット (DOE を使用) を見つけることに非常に熱心でした。この例 (エディンバラ大学による) は、ランニング中に受動的に収集したすべてのセンサー データを分析し、それを使用して「良い」ランニングと「悪い」ランニングを理解する方法をうまく示しています。これを上流の科学者にデモすると、彼らはいつも興奮しているようです。
フィット曲線による細胞増殖
データ リポジトリでこのデータセットを見つけた後、Fit Curve プラットフォームを使用して細胞増殖をプロファイリングする方法を示す簡単なデモンストレーションをセットアップしました。すべての生物学者は、一度は細胞増殖曲線を作成したことがあります。フィット カーブ ツールを使用すると、細胞増殖に最適な条件を見つける際に、分析がより迅速かつ簡単になり、より効果的になります。
学術的な事例研究
また、HPLC での FDE の使用と、細胞増殖を分析するための Fit Curve プラットフォームをカバーする 2 つの学術的なケーススタディも用意しました。これは、教育文書を準備する素晴らしい経験であり、言語を包括的かつ支援しやすいものに保つという興味深い挑戦でした。理解の中で。
デモとワークショップ– 私は幸運にも、Croda、Astrazeneca、Dr Reddy's Laboratories、Biomarin Pharmaceuticals、Fujifilm Diosynth Biotechnologies など、上流および分析開発の能力を拡大しようとしているいくつかのバイオテクノロジーおよびバイオ医薬品企業に私のケーススタディをデモすることができました。顧客に価値を実証し、誰もが簡単に理解できる言葉を使用する方法を学ぶことは非常に役に立ち、これらのスキルを自分自身の博士課程の研究に取り入れました。
私は、3 月 3 日にロンドンで開催された Functional Data Explorer ワークショップの教材の準備にも携わりました。これに参加して、顧客に FDE プラットフォームを教えるのを手伝うことができて本当に良かったです。
JMP で過ごした時間は非常に貴重で、将来のキャリアに活かせる多くのスキルを学びました。私は今後も JMP コミュニティに参加し、ソフトウェアとその使用法を促進していきたいと考えています。
乾杯！
ベン
こんにちは@Bingh94 、
大きな「ありがとう！」を返すことしかできません。インターンシップ中のすべての努力、好奇心、貢献に感謝します。 金曜日のミーティングは、 @Phil_Kayは私にとって常にハイライトであり、素晴らしい学習の機会でした。
マンチェスター大学でお会いしましょう。また将来、JMP でお会いしましょう。
ありがとう！
フォルカー
こんにちは、ベン、
今後のご活躍を心よりお祈り申し上げます。 ケーススタディをありがとうございます。本当に素晴らしいものです。 いつかまたあなたを歓迎できますように、別の推薦状は必要ないと思います 
クロマトグラフィーの分離は、分析法の開発において困難なプロセスとなることが多く、特に医薬品においては実用上および規制上多くの重要性を持っています (USP <621> クロマトグラフィー)。 クロマトグラフィーの分離の問題は、ピークの重なり、テーリングピーク、ゴーストピーク、ベースラインドリフト、感度の低下、カラムの過負荷、不十分なサンプル前処理、カラムの劣化など、複雑かつ多様である可能性があります。
ピーク分解能の問題を解決するには、かなりの専門知識が必要ですが、適切なカラムと移動相を慎重に選択し、流量を最適化することが重要であるため、初心者にとってもプロにとっても同様に困難を伴うことがよくあります。 この使用例は、FDE と JMP Pro にとって実用的かつ強制的なものであることがわかりました。
ベン、来られて嬉しかったです！ あなたは素晴らしいリソースのセットをまとめ、あなたの仕事はより多くの JMP Pro を人々に届けることに大きく貢献しました。
大変感謝しております。 @Bingh94 ！
フロリアン
こんにちは、ベン。興味深く実践的なケーススタディの仕事をしていただき、また時間を割いて整理された概要を参考文献とともに共有していただきありがとうございます。
こんにちは、ベン。あなたが作成した学術的な事例研究は、教員にとって貴重なリソースとなるでしょう。ご貢献に感謝し、ご多幸をお祈り申し上げます。素っ気ない
こんにちは、ベン、
素晴らしい仕事と開発した事例研究に感謝します。代表作！データリポジトリの情報もありがとうございます。 新しいデータ ソースは非常に貴重なものになる可能性があります。
今後のご活躍をお祈り申し上げます。
よろしくお願いします、
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