Bonjour à tous, comme mon stage touche à sa fin le 4 e Avril Je voulais juste écrire un article sur mes expériences chez JMP et le travail que j'ai réalisé.
Tout d'abord, je voulais dire merci à tous ceux de JMP avec qui j'ai interagi ; tout le monde a été extrêmement sympathique et je me suis senti très bien accueilli dès le premier jour. Un grand merci à @volker_kraft et @Phil_Kay pour leurs conseils et leur supervision au cours des derniers mois et pour avoir toléré mes (nombreuses) questions !
Mes objectifs
Au cours de mon stage, j'avais été chargé de me familiariser avec la plateforme Functional Data Explorer et de développer des études de cas à valeur ajoutée pour des démos et des études de cas académiques, notamment dans le domaine des biotechnologies. Mes objectifs étaient de créer des ressources précieuses qui susciteraient l'intérêt des scientifiques et les aideraient également à les éduquer, ainsi qu'à créer des démonstrations et des publications sur les réseaux sociaux via ma série LinkedIn #FunctionalBio.
Trouver des études de cas
Le plus grand défi dans la réalisation des études de cas a été trouver les données – malgré les innombrables publications sur les données fonctionnelles dans les domaines amont et analytique des biotechnologies personne n'a publié son ensemble de données complet. J'ai dressé une liste de référentiels de données utiles que j'ai trouvés (en pièce jointe) pour faciliter la recherche de données, à la fois affiliées à une université et non affiliées.
Les études de cas
Au cours des 3 derniers mois, j'ai rassemblé les études de cas suivantes :
DOE fonctionnel de séparation HPLC
Sur la base de ma propre recherche doctorale et de mon expérience en chromatographie, cet exemple prend la méthode "typique" de mesure de sortie unique avec HPLC (hauteur, largeur et temps de pic) et rassemble le tout dans un profileur facile à lire qui améliore les résultats expérimentaux .
Étude des données du bioréacteur
Avoir ressenti la douleur de faire fonctionner plus de 12 bioréacteurs en une seule fois et de recevoir plusieurs jours de lectures pour plus de 10 capteurs et réflexions « Comment vais-je comprendre cela ? » J'étais très désireux de trouver un ensemble de données de bioréacteur (utilisant DOE) que je pourrais démontrer l'utilisation de FDE. Cet exemple (de l'Université d'Édimbourg) montre bien comment vous pouvez analyser toutes les données de capteur que vous collectez passivement pendant une course et les utiliser pour comprendre ce qu'est une "bonne" et une "mauvaise" course. Quand j'en ai fait la démonstration aux scientifiques en amont, ils ont toujours l'air excité !
Croissance cellulaire avec courbe d'ajustement
Après avoir trouvé cet ensemble de données dans un référentiel de données, j'ai mis en place une démonstration simple qui montre comment la plate-forme Fit Curve peut être utilisée pour profiler la croissance cellulaire. Chaque biologiste à un moment donné a réalisé une courbe de croissance cellulaire - en utilisant l'outil Fit Curve, l'analyse devient plus rapide, plus simple et plus efficace lorsque vous essayez de trouver les meilleures conditions pour votre croissance cellulaire.
Études de cas académiques
J'ai également préparé deux études de cas académiques couvrant l'utilisation de FDE pour HPLC et la plate-forme Fit Curve pour analyser la croissance cellulaire - ce fut une expérience formidable pour préparer des documents pédagogiques et un défi intéressant pour essayer de garder le langage inclusif et simple à aider dans la compréhension.
Démos et ateliers - J'ai eu la chance de présenter mes études de cas à plusieurs sociétés biotechnologiques et biopharmaceutiques qui cherchent à étendre leurs capacités de développement en amont et analytique, notamment Croda, Astrazeneca, Dr Reddy's Laboratories, Biomarin Pharmaceuticals et Fujifilm Diosynth Biotechnologies. Apprendre à démontrer de la valeur aux clients et à utiliser un langage facilement compréhensible par tout le monde a été incroyablement utile et j'ai intégré ces compétences dans ma propre recherche doctorale.
J'ai également participé à la préparation du matériel pédagogique pour l'atelier Functional Data Explorer à Londres le 3 mars - c'était formidable de participer à cela et d'aider à enseigner la plate-forme FDE aux clients !
Mon temps chez JMP a été inestimable et j'ai acquis de nombreuses compétences que j'emporterai avec moi dans ma future carrière. J'espère continuer à m'engager dans la communauté JMP et à promouvoir le logiciel et toutes ses utilisations !
Acclamations!
Ben
