Hola a todos, como mi pasantía llega a su fin el 4 de abril, solo quería escribir una publicación sobre mis experiencias en JMP y el trabajo que he realizado.
En primer lugar, quería agradecer a todos los miembros de JMP con quienes he interactuado; Todos han sido extremadamente amables y me sentí muy bienvenido desde el día 1. ¡Muchas gracias a @volker_kraft y @Phil_Kay por su orientación y supervisión durante los últimos meses y por tolerar mis (muchas) preguntas!
Mis metas
Durante mi pasantía, se me asignó la tarea de familiarizarme con la plataforma Functional Data Explorer y desarrollar estudios de casos de valor agregado para demostraciones y estudios de casos académicos, particularmente en el área de biotecnología. Mis objetivos eran crear recursos valiosos que captaran el interés de los científicos y ayudaran a educarlos también, además de crear demostraciones y publicaciones en las redes sociales a través de mi serie de LinkedIn #FunctionalBio.
Encontrar estudios de caso
El mayor desafío al realizar los estudios de caso fue encontrar los datos : a pesar de la innumerable cantidad de publicaciones sobre datos funcionales en las áreas analíticas y de desarrollo de la biotecnología , nadie publicó su conjunto de datos completo. He reunido una lista de repositorios de datos útiles que encontré (adjuntos) para ayudar con la búsqueda de datos, tanto afiliados como no afiliados a universidades.
Los estudios de caso
Durante los últimos 3 meses, he reunido los siguientes estudios de caso:
Separación por HPLC DOE funcional
Basado en mi propia investigación de doctorado y experiencia en cromatografía, este ejemplo toma el método "típico" de medición de salida única con HPLC (altura, ancho y tiempo de pico) y lo reúne todo en un perfilador fácil de leer que mejora los resultados experimentales. .
Estudio de datos del biorreactor.
Después de haber sentido el dolor de ejecutar más de 12 biorreactores de una sola vez y recibir lecturas de muchos días para >10 sensores y pensar : "¿Cómo voy a entender esto?" Tenía muchas ganas de encontrar un conjunto de datos de biorreactor (utilizando DOE) que pudiera demostrar el uso de FDE. Este ejemplo (de la Universidad de Edimburgo) demuestra muy bien cómo se pueden analizar todos los datos de los sensores que se recopilan pasivamente durante una carrera y usarlos para comprender qué es una carrera "buena" y "mala". Cuando les hago una demostración a los científicos de Upstream, ¡siempre parecen entusiasmados!
Crecimiento celular con curva de ajuste
Después de encontrar este conjunto de datos en un repositorio de datos, configuré una demostración simple que muestra cómo se puede utilizar la plataforma Fit Curve para perfilar el crecimiento celular. Todo biólogo en algún momento ha realizado una curva de crecimiento celular; al utilizar la herramienta Ajustar curva, el análisis se vuelve más rápido, más simple y más efectivo al tratar de encontrar las mejores condiciones para el crecimiento celular.
Estudios de casos académicos
También preparé dos estudios de casos académicos que cubren el uso de FDE para HPLC y la plataforma Fit Curve para analizar el crecimiento celular. Fue una gran experiencia preparar documentos didácticos y un desafío interesante al tratar de mantener el lenguaje inclusivo y simple para ayudar. en entendimiento.
Demostraciones y talleres : he tenido la suerte de presentar mis estudios de caso a varias empresas de biotecnología y biofarmacéutica que buscan ampliar sus capacidades en desarrollo analítico y upstream, incluidas Croda, Astrazeneca, Dr Reddy's Laboratories, Biomarin Pharmaceuticals y Fujifilm Diosynth Biotechnologies. Aprender a demostrar valor a los clientes y utilizar un lenguaje que todos puedan entender fácilmente ha sido increíblemente útil y he incorporado estas habilidades a mi propia investigación de doctorado.
También participé en la preparación del material didáctico para el taller de Functional Data Explorer en Londres el 3 de marzo. ¡Fue fantástico participar en esto y ayudar a enseñar la plataforma FDE a los clientes!
Mi tiempo en JMP ha sido invaluable y he aprendido muchas habilidades que llevaré conmigo en mi futura carrera. ¡Espero seguir participando en la comunidad JMP y promocionando el software y todos sus usos!
¡Salud!
ben
Hola @Bingh94 ,
Sólo puedo devolver un gran "¡gracias!" por todo tu esfuerzo, curiosidad y aportes durante tu pasantía. Nuestras reuniones de los viernes con @Phil_Kay Siempre fueron un momento destacado y una excelente oportunidad de aprendizaje para mí.
Nos vemos en la Universidad de Manchester y tal vez nuevamente en JMP en el futuro.
¡GRACIAS!
Volker
Hola Ben,
¡Le deseo todo lo mejor para sus proyectos futuros! Muchas gracias por los estudios de caso, ¡son cosas realmente geniales! Quizás algún día podamos darle la bienvenida nuevamente, estoy seguro de que no necesitará una carta de referencia por separado 
La resolución cromatográfica a menudo puede ser un proceso desafiante en el desarrollo de métodos analíticos y tiene mucha importancia práctica y regulatoria (cromatografía USP <621>), especialmente en productos farmacéuticos. Los problemas de resolución cromatográfica pueden ser complejos y variados, incluidos picos superpuestos, picos de cola, picos fantasma, deriva de la línea base, sensibilidad deficiente, sobrecarga de la columna, preparación deficiente de la muestra y degradación de la columna, entre otros.
Se requiere un buen grado de experiencia para resolver el problema de resolución máxima, lo que a menudo resulta desalentador tanto para principiantes como para profesionales, ya que es importante seleccionar cuidadosamente la columna y la fase móvil adecuadas y optimizar el caudal. Encontré que este caso de uso es práctico y compulsivo para FDE y JMP Pro.
¡Gracias por compartir tus estudios, Ben!
¡Los mejores deseos!
Peng
¡Ben, fue un placer tenerte! ¡Ha reunido un gran conjunto de recursos y su trabajo ha contribuido mucho a acercar más JMP Pro a la gente!
Un gran gracias, @Bingh94 !
florián
Hola Ben, gracias por tu interesante y práctico trabajo de estudio de casos y por tomarte el tiempo de compartir un resumen organizado con referencias.
Hola Ben, los estudios de casos académicos que desarrollaste serán un recurso valioso para los profesores.Gracias por tus aportes y mejores deseos.Brusco
¡Lo mejor de la comida en tu futuro!
Hola Ben,
Gracias por el gran trabajo y los estudios de caso que desarrolló.¡Trabajo sobresaliente!Gracias también por la información sobre los repositorios de datos. Las nuevas fuentes de datos pueden ser invaluables.
¡La mejor de las suertes en tus futuros intentos!
Atentamente,
Factura
