Ciao a tutti, poiché il mio tirocinio sta per concludersi il 4 aprile , volevo solo scrivere un post sulle mie esperienze in JMP e sul lavoro che ho messo insieme.
Innanzitutto, volevo ringraziare tutti coloro con cui ho interagito in JMP; tutti sono stati estremamente cordiali e mi sono sentito davvero accolto fin dal primo giorno. Un grande ringraziamento a @volker_kraft e @Phil_Kay per la loro guida e supervisione negli ultimi mesi e per aver tollerato le mie (molte) domande!
I miei obiettivi
Durante il mio tirocinio, mi è stato assegnato il compito di acquisire familiarità con la piattaforma Functional Data Explorer e di sviluppare casi di studio a valore aggiunto per demo e casi di studio accademici, in particolare nell'area della biotecnologia. I miei obiettivi erano creare risorse preziose che catturassero l'interesse degli scienziati e aiutassero anche a educarli, oltre a creare dimostrazioni e post sui social media attraverso la mia serie LinkedIn #FunctionalBio.
Trovare casi di studio
La sfida più grande nel realizzare i casi di studio è stata trovare i dati : nonostante l’innumerevole numero di pubblicazioni sui dati funzionali nelle aree a monte e analitiche della biotecnologia , nessuno ha pubblicato il set di dati completo. Ho messo insieme un elenco di archivi di dati utili che ho trovato (in allegato) per aiutare nella ricerca dei dati, sia affiliati all'università che non affiliati.
I casi studio
Negli ultimi 3 mesi ho messo insieme i seguenti casi di studio:
DOE funzionale di separazione HPLC
Basato sulla mia ricerca di dottorato e sulla mia esperienza in cromatografia, questo esempio prende il metodo "tipico" di misurazione a uscita singola con HPLC (altezza, larghezza e tempo del picco) e riunisce il tutto in un profiler di facile lettura che migliora i risultati sperimentali .
Studio dei dati del bioreattore
Dopo aver provato il dolore di far funzionare più di 12 bioreattori in una volta sola e ricevere molti giorni di letture per più di 10 sensori e aver pensato "Come farò a capirlo?" Ero molto ansioso di trovare un set di dati del bioreattore (utilizzando DOE) che potessi dimostrare l'uso di FDE. Questo esempio (dall'Università di Edimburgo) dimostra bene come è possibile analizzare tutti i dati dei sensori raccolti passivamente durante una corsa e utilizzarli per capire cosa è una corsa "buona" e "cattiva". Quando l'ho dimostrato agli scienziati a monte, sembrano sempre entusiasti!
Crescita cellulare con curva di adattamento
Dopo aver trovato questo set di dati in un repository di dati, ho organizzato una semplice dimostrazione che mostra come la piattaforma Fit Curve può essere utilizzata per profilare la crescita cellulare. Ogni biologo ad un certo punto ha eseguito una curva di crescita cellulare: utilizzando lo strumento Fit Curve l'analisi diventa più rapida, semplice ed efficace quando si cerca di trovare le migliori condizioni per la crescita cellulare.
Casi di studio accademici
Ho anche preparato due casi di studio accademici riguardanti l'uso di FDE per HPLC e la piattaforma Fit Curve per analizzare la crescita cellulare: è stata una grande esperienza preparare documenti didattici e una sfida interessante nel cercare di mantenere il linguaggio inclusivo e semplice da aiutare nella comprensione.
Demo e workshop - Ho avuto la fortuna di presentare i miei casi di studio a diverse aziende biotecnologiche e biofarmaceutiche che stanno cercando di espandere le proprie capacità nello sviluppo a monte e analitico, tra cui Croda, Astrazeneca, Dr Reddy's Laboratories, Biomarin Pharmaceuticals e Fujifilm Diosynth Biotechnologies. Imparare a dimostrare valore ai clienti e utilizzare un linguaggio che possa essere facilmente compreso da tutti è stato incredibilmente utile e ho incorporato queste competenze nella mia ricerca di dottorato.
Sono stato anche coinvolto nella preparazione del materiale didattico per il workshop Functional Data Explorer tenutosi a Londra il 3 marzo: è stato fantastico essere coinvolto in questo e aiutare a insegnare la piattaforma FDE ai clienti!
Il tempo trascorso in JMP è stato prezioso e ho acquisito molte competenze che porterò con me nella mia futura carriera. Spero di continuare a impegnarmi nella comunità JMP e a promuovere il software e tutti i suoi usi!
Saluti!
Ben
CIAO @Bingh94 ,
Non posso che ricambiare con un grande "grazie!" per tutti i tuoi sforzi, curiosità e contributi durante il tuo stage. I nostri incontri del venerdì con @Phil_Kay sono sempre stati un momento culminante e un'eccellente opportunità di apprendimento per me.
Ci vediamo all'Università di Manchester e forse di nuovo al JMP in futuro.
GRAZIE!
Volker
Ciao ben,
ti auguro tutto il meglio per i tuoi impegni futuri! Grazie mille per i case study, sono davvero fantastici! Forse una volta potremo darti il bentornato, sono sicuro che non avrai bisogno di una lettera di referenza separata 
La risoluzione cromatografica può spesso rappresentare un processo impegnativo nello sviluppo di metodi analitici e ha molto significato pratico e normativo (cromatografia USP <621>), soprattutto nel settore farmaceutico. I problemi di risoluzione cromatografica possono essere complessi e vari, tra cui picchi sovrapposti, picchi di coda, picchi fantasma, deriva della linea di base, scarsa sensibilità, sovraccarico della colonna, scarsa preparazione del campione e degradazione della colonna, tra gli altri.
È necessario un discreto grado di esperienza per risolvere il problema della risoluzione dei picchi, che spesso è scoraggiante sia per i principianti che per i professionisti poiché è importante selezionare attentamente la colonna e la fase mobile appropriate e ottimizzare la portata. Ho trovato questo caso d'uso pratico e compulsivo per FDE e JMP Pro.
Grazie per aver condiviso i tuoi studi, Ben!
Auguri!
Peng
Ben, è stato un piacere averti! Hai messo insieme un'ampia gamma di risorse e il tuo lavoro ha contribuito moltissimo a portare più JMP Pro a disposizione delle persone!
Un grande grazie, @Bingh94 !
Floriano
Ciao Ben, grazie per il tuo interessante e pratico lavoro di case study e per aver dedicato del tempo a condividere un riepilogo organizzato con riferimenti!
Ciao Ben, i casi di studio accademici che hai sviluppato saranno una risorsa preziosa per i docenti.Grazie per i vostri contributi e i migliori auguri.Brusco
Ti auguro buona fortuna per il tuo futuro!
Ciao Ben,
Grazie per l'ottimo lavoro e i casi di studio che hai sviluppato.Lavoro eccezionale!Grazie anche per le informazioni sui repository di dati. Le nuove fonti di dati possono essere preziose.
Buona fortuna per i tuoi impegni futuri!
Distinti saluti,
Conto
