Hola a todos, ya que mi pasantía está llegando a su fin el 4 el Abril Solo quería escribir una publicación sobre mis experiencias en JMP y el trabajo que he realizado.
En primer lugar, quería dar las gracias a todos los miembros de JMP con los que he interactuado; todos han sido extremadamente amables y me he sentido muy bienvenido desde el primer día. Un gran agradecimiento a @volker_kraft y @Phil_Kay por su orientación y supervisión durante los últimos meses y por tolerar mis (muchas) preguntas.
Mis metas
Durante mi pasantía, tuve la tarea de familiarizarme con la plataforma Functional Data Explorer y desarrollar estudios de casos de valor agregado para demostraciones y estudios de casos académicos, particularmente en el área de biotecnología. Mis objetivos eran crear recursos valiosos que captaran el interés de los científicos y ayudaran a educarlos también, así como crear demostraciones y publicaciones en las redes sociales a través de mi serie de LinkedIn #FunctionalBio.
Encontrar estudios de casos
El mayor desafío al hacer los estudios de caso fue encontrando los datos – a pesar de la innumerable cantidad de publicaciones sobre datos funcionales en las áreas upstream y analíticas de la biotecnología nadie publicó su conjunto completo de datos. Reuní una lista de repositorios de datos útiles que encontré (adjuntos) para ayudar con la búsqueda de datos, tanto afiliados a universidades como no afiliados.
los estudios de casos
En los últimos 3 meses he reunido los siguientes casos de estudio:
Separación HPLC funcional DOE
Basado en mi propia investigación de doctorado y experiencia en cromatografía, este ejemplo toma el método 'típico' de medición de salida única con HPLC (altura, ancho y tiempo de pico) y lo reúne todo en un perfilador fácil de leer que mejora los resultados experimentales. .
Estudio de datos del biorreactor
Después de haber sentido el dolor de hacer funcionar más de 12 biorreactores de una sola vez y recibir muchos días de lecturas de más de 10 sensores y pensar '¿Cómo voy a entender esto?' Tenía muchas ganas de encontrar un conjunto de datos de biorreactor (usando DOE) que pudiera demostrar el uso de FDE. Este ejemplo (de la Universidad de Edimburgo) demuestra muy bien cómo puede analizar todos los datos de los sensores que recopila de forma pasiva durante una ejecución y utilizarlos para comprender qué es una "buena" y una "mala" ejecución. Cuando he mostrado esto a Upstream Scientists, ¡siempre parecen emocionados!
Crecimiento celular con curva de ajuste
Después de encontrar este conjunto de datos en un repositorio de datos, configuré una demostración simple que muestra cómo se puede usar la plataforma Fit Curve para perfilar el crecimiento celular. Todos los biólogos en algún momento han realizado una curva de crecimiento celular: al usar la herramienta Ajustar curva, el análisis se vuelve más rápido, más simple y más efectivo al tratar de encontrar las mejores condiciones para el crecimiento celular.
Estudios de casos académicos
También preparé dos estudios de casos académicos que cubren el uso de FDE para HPLC y la plataforma Fit Curve para analizar el crecimiento celular: fue una gran experiencia preparar documentos didácticos y un desafío interesante para tratar de mantener el lenguaje inclusivo y simple de ayudar. en entendimiento.
Demostraciones y Talleres - He tenido la suerte de demostrar mis estudios de caso a varias empresas biotecnológicas y biofarmacéuticas que buscan expandir sus capacidades en el desarrollo analítico y ascendente, incluidas Croda, Astrazeneca, Dr Reddy's Laboratories, Biomarin Pharmaceuticals y Fujifilm Diosynth Biotechnologies. Aprender a demostrar valor a los clientes y usar un lenguaje que todos puedan entender fácilmente ha sido increíblemente útil y he tomado estas habilidades en mi propia investigación de doctorado.
También participé en la preparación del material didáctico para el taller de Functional Data Explorer en Londres el 3 de marzo. ¡Fue genial participar en esto y ayudar a enseñar la plataforma FDE a los clientes!
Mi tiempo en JMP ha sido invaluable y he aprendido muchas habilidades que llevaré conmigo en mi futura carrera. ¡Espero seguir participando en la comunidad JMP y promocionando el software y todos sus usos!
¡Salud!
ben
