Ciao a tutti, poiché il mio tirocinio sta per concludersi il 4 th Aprile Volevo solo scrivere un post sulle mie esperienze in JMP e sul lavoro che ho messo insieme.
In primo luogo, volevo ringraziare tutti quelli di JMP con cui ho interagito; tutti sono stati estremamente amichevoli e mi sono sentito molto ben accolto sin dal primo giorno. Un grande grazie a @volker_kraft E @Phil_Kay per la loro guida e supervisione negli ultimi mesi e per aver tollerato le mie (molte) domande!
I miei obiettivi
Durante il mio tirocinio, mi è stato affidato il compito di acquisire familiarità con la piattaforma Functional Data Explorer e di sviluppare casi di studio a valore aggiunto per dimostrazioni e casi di studio accademici, in particolare nel settore della biotecnologia. I miei obiettivi erano creare risorse preziose che catturassero l'interesse degli scienziati e aiutassero anche a istruirli, oltre a creare dimostrazioni e post sui social media attraverso la mia serie LinkedIn #FunctionalBio.
Ricerca di casi di studio
La sfida più grande nel realizzare i casi di studio è stata trovare i dati – nonostante il numero infinito di pubblicazioni sui dati funzionali nelle aree a monte e analitiche della biotecnologia nessuno ha pubblicato il proprio set di dati completo. Ho messo insieme un elenco di archivi di dati utili che ho trovato (allegato) per aiutare con la ricerca dei dati, sia affiliati all'università che non affiliati.
I casi di studio
Negli ultimi 3 mesi ho messo insieme i seguenti case study:
Separazione HPLC Funzionale DOE
Basato sulla mia ricerca di dottorato di ricerca e sulla mia esperienza in cromatografia, questo esempio prende il metodo "tipico" della misurazione dell'output singolo con HPLC (altezza del picco, larghezza e tempo) e lo riunisce in un profiler di facile lettura che migliora i risultati sperimentali .
Studio dei dati del bioreattore
Avendo provato il dolore di far funzionare più di 12 bioreattori in una volta sola e aver ricevuto molti giorni di letture per > 10 sensori e aver pensato "Come faccio a capirlo?" Ero molto ansioso di trovare un set di dati del bioreattore (usando DOE) che potessi dimostrare l'uso di FDE. Questo esempio (dall'Università di Edimburgo) dimostra bene come puoi analizzare tutti i dati dei sensori che raccogli passivamente durante una corsa e utilizzarli per capire cosa è una corsa "buona" e "cattiva". Quando l'ho presentato agli scienziati a monte, sembrano sempre entusiasti!
Crescita cellulare con curva di adattamento
Dopo aver trovato questo set di dati in un repository di dati, ho creato una semplice dimostrazione che mostra come la piattaforma Fit Curve può essere utilizzata per profilare la crescita cellulare. Ogni biologo ad un certo punto ha eseguito una curva di crescita cellulare: utilizzando lo strumento Fit Curve l'analisi diventa più rapida, semplice ed efficace quando si cerca di trovare le migliori condizioni per la crescita cellulare.
Casi di studio accademici
Ho anche preparato due casi di studio accademici riguardanti l'uso di FDE per HPLC e la piattaforma Fit Curve per l'analisi della crescita cellulare: è stata una grande esperienza preparare documenti didattici e una sfida interessante nel cercare di mantenere il linguaggio inclusivo e semplice da aiutare nella comprensione.
Dimostrazioni e Workshop - Ho avuto la fortuna di dimostrare i miei case study a diverse aziende biotecnologiche e biofarmaceutiche che stanno cercando di espandere le proprie capacità nello sviluppo a monte e analitico, tra cui Croda, Astrazeneca, Dr Reddy's Laboratories, Biomarin Pharmaceuticals e Fujifilm Diosynth Biotechnologies. Imparare a dimostrare valore ai clienti e utilizzare un linguaggio che può essere facilmente compreso da tutti è stato incredibilmente utile e ho trasferito queste abilità nella mia ricerca di dottorato.
Sono stato anche coinvolto nella preparazione del materiale didattico per il workshop Functional Data Explorer a Londra il 3 marzo: è stato fantastico essere coinvolto e aiutare a insegnare la piattaforma FDE ai clienti!
Il mio tempo in JMP è stato prezioso e ho acquisito molte competenze che porterò con me nella mia futura carriera. Spero di continuare a impegnarmi nella comunità di JMP ea promuovere il software e tutti i suoi usi!
Saluti!
Ben
