En el cuadro de diálogo, cuando ingresa el valor de "diferencia", también puede ingresar el nivel alfa.Esto controlará el ancho del intervalo de confianza.
Hola @CoxPanther919 ,
¡Bienvenido a la Comunidad! 
Sí, la barra de error representa el intervalo de confianza del 90 % del TOST que has realizado.
Dado que está realizando una prueba de dos lados, cada prueba de un lado utilizará el alfa que haya especificado en la ventana de inicio (0,05 de forma predeterminada, por lo que el nivel de confianza = 0,95), pero está haciendo dos comparaciones en un TOST: una para valor superior, otra para valor inferior, por lo que su confianza "global" para el TOST es 0,95 elevado a 2 (2 pruebas o comparaciones realizadas) = 0,90.
Si desea tener un intervalo de confianza del 95%, deberá especificar un valor alfa de 0,025 (o dicho de otro modo, un nivel de confianza de 0,975 para cada prueba): 0,975^2 = 0,95.
Un ejemplo práctico aquí:

Resultado :

Espero haber entendido tu pregunta y que esta respuesta te ayude,
Hola @Victor_G ,
muchas gracias, esa era exactamente mi pregunta!
Atentamente
Hola juntos,
Soy nuevo en jmp17 e intenté hacer una prueba TOST.
En Ajustar Y por X, seleccioné Prueba de equivalencia --> Medias.
Con respecto al diagrama de bosque, me preguntaba si los intervalos de confianza del 90 % para la diferencia son la barra de error en el diagrama y si hay alguna manera de ajustar el intervalo de confianza.

¡Gracias!