Bonjour à tous,
J'ai réalisé une vidéo de démonstration sur l'utilisation des outils Fit Curve et Curve DoE dans JMP Pro 17 pour l'analyse des données de croissance cellulaire. Il s’agit d’un bel exemple qui suscitera rapidement l’intérêt d’un large éventail de scientifiques impliqués dans les mesures de croissance cellulaire (bioprocédés, génétique).
L'exemple utilise les lectures de densité optique d'un lecteur de plaques mesurant différentes lignées cellulaires (différentes souches génétiquement modifiées) sur différents pourcentages de maltose. La démo montre à quelle vitesse les scientifiques peuvent obtenir des paramètres significatifs (c'est-à-dire le taux de croissance) et des profils en quelques minutes à partir de leurs données.
Certains clients peuvent se demander pourquoi ils n'utiliseraient pas simplement Functional Data Explorer ; l'utilisation des modèles mécanistiques prédéterminés dans Fit Curve permettra de mieux adapter la forme attendue de la croissance cellulaire, en particulier dans la « phase stationnaire » de la croissance. Avec FDE, cela n'est généralement pas bien présenté, surtout lorsque les données sont variables ou bruitées.
Aperçu
Qui trouverait cela utile ?
- Groupes se concentrant sur la culture microbienne ou mammifère – cela peut inclure des groupes de bioprocédés (mammifères, microbiens, algues) ou génétiques – généralement au stade de la R+D.
- Attention à la mention d'équipements (« bioréacteur », « lecteur de plaques », « microbioréacteur ») tels que l' Ambr15 (Sartorius), le Biolector/Robolector (Beckman Coulter), le Shake Flask Reader (Kuhner).
Valeur commerciale
- Vitesse accrue de développement et de mise à l’échelle des processus : une identification plus rapide des paramètres de processus bénéfiques accélère la R+D sans nécessiter d’exécutions supplémentaires.
Valeur scientifique
- Obtenez rapidement des paramètres précieux en quelques minutes plutôt que de les identifier « à l'œil nu » ou de calculer les valeurs à la main.
- Appliquer des profils cibles pour explorer les paramètres permettant d'atteindre les objectifs.
- Guide des expérimentations supplémentaires pour une croissance cellulaire améliorée.
- Facilité de communication avec l'outil de profilage.
Excellent – bel exemple, belle présentation et superbe description ! Merci @Bingh94