關於篩選 DoE 中特定因素組合的問題(例如 DSD)親愛的社區,
我用 DoE 進行了很多蛋白質緩衝液配方篩選,其中一個重要參數是緩衝液分子(例如磷酸鹽、Tris 等)及其特定的 pH 範圍。
是否有任何可能的設計,我可以在一個設計實驗中測試其 pH 範圍內的多個緩衝分子(例如,pH 5.5 至 pH 7 之間的組蛋白和 pH 5 至 pH 9 之間的 Tris)? 我遇到的問題是,我無法測試緩衝液分子的組合,因為每種緩衝液的 pH 值(例如 pH 9 的 Tris 和 pH 7 的組蛋白)在新 pH 的結果中相互影響很大。
我是否必須為每個緩衝區運行一個單獨的 DoE 屏幕,或者是否有一個技巧可以一起測量並避免每個緩衝區的 pH 值的全局干擾? 除了緩衝液之外,還測量了其他因素,例如 NaCl 等,這些因素不會對 pH 產生太大影響。
感謝幫助
美國能源部視窗回复:關於篩選 DoE 中特定因素組合的問題(例如 DSD)順便說一句,如果設計很容易創建為每個緩衝區的單獨設計,那麼在創建表後將兩個設計連接成一個設計並進行評估並不是一件大事。 有時,考慮簡單的部分並將它們組合起來比構建更複雜的部分更容易。 每種方式都有優點和缺點。
回复:關於篩選 DoE 中特定因素組合的問題(例如 DSD)我不是 100% 確定你解釋的因子約束,但據我所知,你不能將緩衝分子視為阻塞因子,然後使用 JMP 定制設計平台的線性約束部分來約束 pH特定緩衝分子的水平? 正如您在倒數第二句中所建議的那樣,它基本上是在設置與單獨的“DoE 屏幕”沒有太大區別的東西。 它只是合併在一個設計矩陣中,並為感興趣的因素提供適當的模型規範。 包括如何處理阻塞變量。
另一個想法......除非我遺漏了一些東西,否則我認為 DSD 不是一個可行的選擇,因為設計的折疊性質與 pH 因素有關......你必須讓 pH 水平折疊起來整個設計。 因此,具有適當模型規範(包括如何處理分塊變量)的 d 最優設計可能是篩選設計的最佳選擇。
我確定其他人也可能有什麼建議?