Question sur la combinaison de facteurs spécifiques dans le dépistage DoE (par exemple, DSD)Chère communauté,
Je fais beaucoup d'écrans de formulation de tampons protéiques avec DoE et un paramètre important est la molécule tampon (par exemple Phosphate, Tris, etc.) et sa plage de pH spécifique.
Existe-t-il une conception possible où je peux tester plusieurs molécules tampons dans leur plage de pH (par exemple, l'histidine entre pH 5,5 et pH 7 et le Tris entre pH 5 et pH 9) dans une expérience de conception ? Le problème que j'ai est que je ne peux pas tester des combinaisons de molécules tampons car le pH de chaque tampon (par exemple Tris à pH 9 et Histidine à pH 7) s'influence beaucoup dans les résultats d'un nouveau pH.
Dois-je exécuter un écran DoE séparé pour chaque tampon ou existe-t-il une astuce pour mesurer tous ensemble et éviter une interférence globale du pH de chaque tampon ? Outre le tampon, d'autres facteurs tels que NaCl, etc. sont également mesurés, qui n'interfèrent pas tellement avec le pH.
Merci pour l'aide
BICHEles fenêtresRe : Question sur la combinaison de facteurs spécifiques dans le dépistage DoE (par exemple, DSD)Soit dit en passant, si la conception est facile à créer en tant que conception distincte pour chaque tampon, il ne serait pas difficile de concaténer les deux conceptions en une seule après la création de la table et de les évaluer. Parfois, il est plus facile de penser en parties simples et de les combiner, au lieu d'en construire une plus complexe. Il y a des avantages et des inconvénients pour chaque trajet.
Re : Question sur la combinaison de facteurs spécifiques dans le dépistage DoE (par exemple, DSD)Je ne suis pas sûr à 100 % des contraintes de facteur que vous avez expliquées, mais d'après ce que je peux comprendre, ne pouvez-vous pas traiter la molécule tampon comme un facteur de blocage, puis utiliser la partie contraintes linéaires de la plate-forme JMP Custom Design pour contraindre le pH niveaux pour des molécules tampons spécifiques ? Il s'agit essentiellement de configurer quelque chose de pas trop différent d'un «écran DoE» séparé, comme vous le suggérez dans votre avant-dernière phrase. Il est simplement fusionné dans une matrice de conception, avec une spécification de modèle appropriée pour les facteurs d'intérêt. Y compris comment gérer la variable de blocage.
Une autre pensée ... À moins que je ne manque quelque chose, je ne pense pas qu'un DSD soit une option viable en raison de la nature repliable de la conception par rapport au facteur de pH ... vous devez faire en sorte que les niveaux de pH se replient dans toute la conception. Ainsi, une conception d-optimale, avec la spécification de modèle appropriée (y compris la façon de gérer la variable de blocage) est probablement votre meilleur pari pour une conception de criblage.
Je suis sûr que d'autres pourraient aussi avoir quelque chose à suggérer?
