关于筛选 DoE 中特定因素组合的问题(例如 DSD)亲爱的社区,
我用 DoE 进行了很多蛋白质缓冲液配方筛选,其中一个重要参数是缓冲液分子(例如磷酸盐、Tris 等)及其特定的 pH 范围。
是否有任何可能的设计,我可以在一个设计实验中测试其 pH 范围内的多个缓冲分子(例如,pH 5.5 至 pH 7 之间的组蛋白和 pH 5 至 pH 9 之间的 Tris)? 我遇到的问题是,我无法测试缓冲液分子的组合,因为每种缓冲液的 pH 值(例如 pH 9 的 Tris 和 pH 7 的组蛋白)在新 pH 的结果中相互影响很大。
我是否必须为每个缓冲区运行一个单独的 DoE 屏幕,或者是否有一个技巧可以一起测量并避免每个缓冲区的 pH 值的全局干扰? 除了缓冲液之外,还测量了其他因素,例如 NaCl 等,这些因素不会对 pH 产生太大影响。
感谢帮助
美国能源部视窗回复:关于筛选 DoE 中特定因素组合的问题(例如 DSD)顺便说一句,如果设计很容易创建为每个缓冲区的单独设计,那么在创建表后将两个设计连接成一个设计并进行评估并不是一件大事。 有时,考虑简单的部分并将它们组合起来比构建更复杂的部分更容易。 每种方式都有优点和缺点。
回复:关于筛选 DoE 中特定因素组合的问题(例如 DSD)我不是 100% 确定你解释的因子约束,但据我所知,你不能将缓冲分子视为阻塞因子,然后使用 JMP 定制设计平台的线性约束部分来约束 pH特定缓冲分子的水平? 正如您在倒数第二句中所建议的那样,它基本上是在设置与单独的“DoE 屏幕”没有太大区别的东西。 它只是合并在一个设计矩阵中,并为感兴趣的因素提供适当的模型规范。 包括如何处理阻塞变量。
另一个想法......除非我遗漏了一些东西,否则我认为 DSD 不是一个可行的选择,因为设计的折叠性质与 pH 因素有关......你必须让 pH 水平折叠起来整个设计。 因此,具有适当模型规范(包括如何处理分块变量)的 d 最优设计可能是筛选设计的最佳选择。
我确定其他人也可能有什么建议?