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Gráfica de escalamiento multidimensional: agrupación/agrupamiento de puntos

Estoy usando una escala multidimensional en una matriz de distancia de 91 x 91. Cuando se muestra el gráfico 2D MDS, los puntos se trazan usando varios símbolos y colores diferentes asignados por JMP, evidentemente agrupando puntos en función de su proximidad en el espacio de distancia multidimensional (ver captura de pantalla adjunta). Preguntas:

1. ¿Cuál es el criterio que utiliza JMP para decidir cómo agrupar o agrupar puntos?
   
   
2. ¿Hay alguna forma de ajustar el criterio o el umbral de cómo se agrupan los puntos?
   
   
3. ¿Hay alguna manera fácil de obtener un informe sobre cuántos grupos se han encontrado (aparte de contarlos manualmente en el gráfico; no es práctico para grandes conjuntos de datos)?

He buscado en la documentación de JMP y en Google y no he podido encontrar nada al respecto.

Estoy buscando (preferiblemente) respuestas que no dependan de secuencias de comandos.

Gracias de antemano por cualquier ayuda.

Re: Gráfica de escalado multidimensional: agrupación/agrupamiento de puntosAh, ahora veo lo que pasó. De hecho, ya había usado la agrupación jerárquica con este mismo conjunto de datos (hace muchos meses). Recientemente, un colega me sugirió que probara MDS como un enfoque alternativo para el tipo de análisis que necesitaba. Volví a abrir mi archivo JMP guardado y ejecuté la matriz de distancia a través de MDS, sin darme cuenta de que las etiquetas de conglomerados generadas por el análisis de conglomerados todavía estaban en el archivo. Así que estaba viendo el gráfico 2D de MDS, pero etiquetado (sin darme cuenta) de acuerdo con el resultado del análisis de conglomerados anterior. Entonces, gracias a su respuesta, ahora entiendo lo que sucedió. Cuando cerré todos los archivos y volví a importar la matriz de distancia, las etiquetas y la codificación de colores desaparecieron, como se esperaba.

Muchas gracias, ahora todo tiene sentido.
Re: Gráfica de escalado multidimensional: agrupación/agrupamiento de puntos

Hay un par de conceptos erróneos comprensibles en sus preguntas.

 

Los colores y marcadores no son generados por la plataforma de Escalamiento Multidimensional. Ellos son las estados de fila ya asignado en su tabla de datos.

 

 

MDS no realiza ningún agrupamiento o agrupación. (Es por eso que no puede encontrarlo en la documentación). Parafrasear Wikipedia : MDS traduce las 'distancias' por pares de sus datos en un espacio cartesiano abstracto.

 

Si desea un algoritmo de agrupamiento, puede usar el Clúster de K-medias plataforma. Le permitirá ajustar la cantidad de grupos e informar qué filas pertenecen a qué grupo.

 

Re: Gráfica de escalado multidimensional: agrupación/agrupamiento de puntosGracias por la sugerencia @markbailey, pero el capítulo del libro no arroja ninguna luz sobre estas preguntas.Re: Gráfica de escalado multidimensional: agrupación/agrupamiento de puntos

Le sugiero que seleccione en JMP: Ayuda > Libros > Métodos multivariados. Se dedica un capítulo a los MDS. La última sección del capítulo presenta detalles estadísticos.