¿Qué inspiró esta solicitud de lista de deseos?
Actualmente, esto no es posible y requerimos que los clientes comiencen con datos normalizados con métodos fuera de la lista de transformación de JMP/JMP Pros. Esto funciona, pero eso significa que se debe usar otra herramienta fuera de JMP antes de usar en JMP/JMP Pro.
Describa la función o solución nueva o mejorada que le gustaría ver.
Esta referencia resume el problema:
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1874-1
WE puede hacer transformaciones de log2 (x + 1) en columnas, lo que parece ser una alternativa aceptable, pero tiene sus propios problemas con los datos de conteo que también son muy escasos.
Agregar algunos métodos de adición (VST y/o Dispersión) para los datos de secuenciación de ARN de una sola célula ayudará con algunos de estos problemas.
¿Cuál sería el valor para usted y/u otros usuarios si se proporciona esta nueva función?
Haga más dentro de JMP en lugar de tener que usar otras herramientas primero, lo que podría atraer a un cliente para que permanezca en esa herramienta en lugar de ir a JMP/JMP Pro.
¿Es esta una solicitud de un cliente externo?
Sí, Farmacéutica Ionis
¿Hay algún paquete de software de la competencia que tenga esta característica o solución que debamos conocer?
R/Bioconductor es la principal fuente de competencia.
¿Esto afectará una renovación, expansión o adopción en un cliente, y pone esto en riesgo una cuenta si no abordamos esto?
El cliente está evaluando JMP Pro para este tipo de datos. Actualmente pueden obtener datos normalizados y podría tener un impacto bajo para este cliente, pero poder comenzar y permanecer dentro de JMP Pro podría influir en ellos. Queda por ver qué sucede con la evaluación.
