Cosa ha ispirato questa richiesta di lista dei desideri? Descrivi il problema attuale che necessita di miglioramenti o il nuovo problema da risolvere che non è facile o possibile in questo momento.
In JMP Genomics, esisteva un'opzione per importare i file SAM/BAM e quindi ottenere le chiamate alle varianti da questi file. Dall'interruzione di JMP Genomics, alcune funzionalità sono state trasferite su JMP Pro. Questo non è uno di loro
Descrivi la funzionalità o la soluzione nuova o migliorata che vorresti vedere.
- Consenti l'importazione di file SAM/BAM e crea chiamate di varianti da questi file.
- La specifica è elencata in questo collegamento
- Immagino un'opzione all'interno di JMP Pro in File> Apri che consenta di importare questi file e quindi di creare una variante che chiama come usa JMP Genomics per essere in grado di fare.
Quale sarebbe il valore per te e/o per gli altri utenti se venisse fornita questa nuova funzionalità? Qualsiasi informazione su facilità d'uso, tempo risparmiato, nuovo valore delle funzionalità sarebbe apprezzata. Se si tratta di una funzionalità disponibile tramite altre soluzioni software, descrivere tale strumento software.
Consente di importare un formato di file comune nel campo genomico per ottenere dati genetici in JMP Pro per l'analisi
È una richiesta di un cliente esterno? In tal caso, fornire il nome dell'account del cliente, i principali punti di contatto e gli utenti che hanno effettuato la richiesta.
Sì, USDA-ARS
Esiste un pacchetto software competitivo che ha questa caratteristica o soluzione di cui dovremmo essere a conoscenza? Fornisci tutte le informazioni possibili sul software della concorrenza, inclusi collegamenti a siti Web, demo o esempi.
R/Bioconduttore, Strumenti SAM
Ciò avrà un impatto su un rinnovo, un'espansione o un'adozione da parte di un cliente e questo mette a rischio un account se non affrontiamo questo problema? Fornisci dettagli ragionevoli e una descrizione del problema specifico dell'account.
Il cliente è un cliente del governo degli Stati Uniti e ha una licenza di 50 anni, quindi anche se non rinnova, ha comunque una licenza che dura a lungo. Aiuta a migrare i clienti di JMP Genomics a JMP Pro.
Come nota a margine, non penso che dovremmo farlo poiché ci sono altri strumenti gratuiti che possono creare le chiamate varianti e salvarle come file di testo o file VCF. Non ci occupiamo di bioinformatica. Invio di questo per conto dei clienti.
