このウィッシュ リスト リクエストのきっかけは何ですか? 改善が必要な現在の問題、または解決が容易ではない、または現時点では不可能な新しい問題について説明してください。
TMM、RPKM、TPM、KDMM、比率の中央値などの追加の RNA-seq 正規化方法を許可する
ご希望の新機能または改善された機能またはソリューションについて説明してください。
この新機能が提供された場合、あなたや他のユーザーにとってどのような価値がありますか? 使いやすさ、時間の節約、新しい機能の価値に関する情報をいただければ幸いです。 これが他のソフトウェア ソリューションで利用できる機能である場合は、そのソフトウェア ツールについて説明してください。
このデータの分析を支援するために、RNA-seq データに使用される一般的な変換/正規化方法を提供します。
[列] メニューまたは右クリックして [新しい列の数式] から、これらを含む変換オプションを提供します。 出力の列に列式を含めないでください (これらのメソッドは、数百のサンプル/行にわたって数万の列に適用されます)。
これは外部の顧客の要求ですか? その場合は、お客様のアカウント名と主要な連絡先、およびリクエストを行ったユーザーをお知らせください。
はい、USDA-ARS ですが、この種のデータを扱う他の人の間でも一般的です。以前は JMP Genomics にありました。
知っておくべきこの機能またはソリューションを備えた競合ソフトウェア パッケージはありますか? Web サイト、デモ、例へのリンクなど、競合ソフトウェアに関する情報を提供してください。
R/Bioconductor 他の遺伝子発現解析ツール (GeneSpring、Omic Soft など)
これは顧客での更新、拡張、または採用に影響を与えますか? また、これに対処しない場合、アカウントが危険にさらされますか? アカウント固有の問題の合理的な詳細と説明を提供してください。
確かではありませんが、顧客のためにこのデータを生成できるバイオインフォマティクス部門を持たない小規模な組織では、新規の売上が妨げられる可能性があります。