Cosa ha ispirato questa richiesta di lista dei desideri? Descrivi il problema attuale che necessita di miglioramenti o il nuovo problema da risolvere che non è facile o possibile in questo momento.
Consenti ulteriori metodi di normalizzazione RNA-seq come TMM, RPKM, TPM, KDMM, mediana dei rapporti
Descrivi la funzionalità o la soluzione nuova o migliorata che vorresti vedere.
Quale sarebbe il valore per te e/o per gli altri utenti se venisse fornita questa nuova funzionalità? Qualsiasi informazione sulla facilità d'uso, sul risparmio di tempo e sul valore delle nuove funzionalità sarebbe apprezzata. Se questa è una funzionalità disponibile tramite altre soluzioni software, descrivi lo strumento software.
Fornire metodi comuni di trasformazione/normalizzazione utilizzati per i dati RNA-seq per facilitare l'analisi di questi dati.
Dal menu Col. o facendo clic con il pulsante destro del mouse e Nuova formula colonna, fornire le opzioni di trasformazione che le includono. L'output non deve includere formule di colonna nelle colonne (questi metodi vengono applicati a decine di migliaia di colonne su centinaia di campioni/righe)
Si tratta di una richiesta di un cliente esterno? In tal caso, fornisci il nome dell'account cliente, i principali punti di contatto e gli utenti che hanno effettuato la richiesta.
Sì, USDA-ARS, ma comune anche tra gli altri che lavorano con questo tipo di dati. era in JMP Genomics. Anche Cornell e Cargill
Esiste un pacchetto software competitivo dotato di questa funzionalità o soluzione di cui dovremmo essere a conoscenza? Fornisci tutte le informazioni possibili sul software della concorrenza, inclusi collegamenti a siti Web, demo o esempi.
R/Bioconductor altri strumenti di analisi dell'espressione genica (GeneSpring, Omic Soft, ecc.)
Ciò avrà un impatto sul rinnovo, sull'espansione o sull'adozione da parte di un cliente e metterà a rischio l'account se non affrontiamo questo problema? Fornisci dettagli ragionevoli e una descrizione del problema specifico dell'account.
Non ne sono sicuro, ma potrebbe impedire nuove vendite per le organizzazioni più piccole che non dispongono di dipartimenti di bioinformatica in grado di generare questi dati per il cliente.
@Chris_Kirchberg - Grazie per il tuo suggerimento! Abbiamo catturato la tua richiesta e la prenderemo in considerazione.
