Cosa ha ispirato questa richiesta di lista dei desideri? Descrivi il problema attuale che necessita di miglioramenti o il nuovo problema da risolvere che non è facile o possibile in questo momento.
Consenti ulteriori metodi di normalizzazione RNA-seq come TMM, RPKM, TPM, KDMM, Median of Ratios
Descrivi la funzionalità o la soluzione nuova o migliorata che vorresti vedere.
Quale sarebbe il valore per te e/o per gli altri utenti se venisse fornita questa nuova funzione? Qualsiasi informazione su facilità d'uso, tempo risparmiato, nuovo valore delle funzionalità sarebbe apprezzata. Se si tratta di una funzionalità disponibile tramite altre soluzioni software, descrivere tale strumento software.
Fornire metodi comuni di trasformazione/normalizzazione utilizzati per i dati RNA-seq per facilitare l'analisi di questi dati.
Dal menu Cols o facendo clic con il pulsante destro del mouse e Nuova formula colonna, fornire le opzioni di trasformazione che le includono. L'output non deve includere formule di colonna nelle colonne (questi metodi vengono applicati a 10.000 colonne su 100 campioni/righe)
È una richiesta di un cliente esterno? In tal caso, fornire il nome dell'account del cliente, i principali punti di contatto e gli utenti che hanno effettuato la richiesta.
Sì, USDA-ARS ma anche comune tra gli altri che lavorano con questo tipo di dati. era in JMP Genomics.
Esiste un pacchetto software competitivo che ha questa caratteristica o soluzione di cui dovremmo essere a conoscenza? Fornisci tutte le informazioni possibili sul software della concorrenza, inclusi collegamenti a siti Web, demo o esempi.
R/Bioconductor altri strumenti di analisi dell'espressione genica (GeneSpring, Omic Soft, ecc.)
Ciò avrà un impatto su un rinnovo, un'espansione o un'adozione da parte di un cliente e questo mette a rischio un account se non affrontiamo questo problema? Fornisci dettagli ragionevoli e una descrizione del problema specifico dell'account.
Non ne sono sicuro, ma potrebbe impedire nuove vendite per le organizzazioni più piccole che non dispongono di dipartimenti di bioinformatica in grado di generare questi dati per il cliente.
