Was hat diese Wunschlistenanfrage inspiriert? Bitte beschreiben Sie das aktuelle Problem, das verbessert werden muss, oder das neue Problem, das gelöst werden muss und das derzeit nicht einfach oder möglich ist.
Ermöglichen Sie zusätzliche RNA-seq-Normalisierungsmethoden wie TMM, RPKM, TPM, KDMM, Median of Ratios
Bitte beschreiben Sie die neue oder verbesserte Funktion oder Lösung, die Sie sehen möchten.
Welchen Nutzen hätte es für Sie und/oder andere Benutzer, wenn diese neue Funktion bereitgestellt würde? Für Informationen zur Benutzerfreundlichkeit, zur Zeitersparnis und zum Wert neuer Funktionen wären wir dankbar. Wenn es sich um eine Funktion handelt, die Ihnen über andere Softwarelösungen zur Verfügung steht, beschreiben Sie bitte dieses Softwaretool.
Stellen Sie gängige Transformations-/Normalisierungsmethoden bereit, die für RNA-seq-Daten verwendet werden, um die Analyse dieser Daten zu unterstützen.
Stellen Sie im Menü „Spalten“ oder per Rechtsklick und „Neue Spaltenformel“ Transformationsoptionen bereit, die diese enthalten. Die Ausgabe sollte keine Spaltenformeln in den Spalten enthalten (diese Methoden werden auf 10.000 Spalten über 100 Proben/Zeilen hinweg angewendet).
Handelt es sich um eine externe Kundenanfrage? Wenn ja, geben Sie bitte den Namen des Kundenkontos sowie die wichtigsten Ansprechpartner und Benutzer an, die die Anfrage gestellt haben.
Ja, USDA-ARS, aber auch bei anderen üblich, die mit dieser Art von Daten arbeiten. War früher bei JMP Genomics. Auch Cornell und Cargill
Gibt es ein konkurrierendes Softwarepaket mit dieser Funktion oder Lösung, die wir kennen sollten? Bitte stellen Sie alle möglichen Informationen zu Konkurrenzsoftware bereit, einschließlich Links zu Websites, Demos oder Beispielen.
R/Bioconductor, andere Tools zur Genexpressionsanalyse (GeneSpring, Omic Soft usw.)
Wird sich dies auf eine Erneuerung, Erweiterung oder Einführung bei einem Kunden auswirken und stellt dies ein Risiko für ein Konto dar, wenn wir uns nicht darum kümmern? Bitte geben Sie angemessene Einzelheiten und eine Beschreibung des kontospezifischen Problems an.
Ich bin mir nicht sicher, aber es könnte neue Verkäufe für kleinere Organisationen verhindern, die nicht über Bioinformatikabteilungen verfügen, die diese Daten für den Kunden generieren können.
@Chris_Kirchberg - Danke für deinen Vorschlag! Wir haben Ihre Anfrage erfasst und werden diese prüfen.
