Was hat Sie zu dieser Wish List-Anfrage inspiriert? Bitte beschreiben Sie das aktuelle Problem, das verbessert werden muss, oder das neue Problem, das gelöst werden muss und das derzeit nicht einfach oder möglich ist.
Erlauben Sie zusätzliche RNA-seq-Normalisierungsmethoden wie TMM, RPKM, TPM, KDMM, Median of Ratios
Bitte beschreiben Sie die neue oder verbesserte Funktion oder Lösung, die Sie sehen möchten.
Welchen Wert hätte es für Sie und/oder andere Benutzer, wenn diese neue Funktion bereitgestellt wird? Jede Information über Benutzerfreundlichkeit, Zeitersparnis, neuen Funktionswert wäre willkommen. Wenn es sich um eine Funktion handelt, die Ihnen über andere Softwarelösungen zur Verfügung steht, beschreiben Sie bitte dieses Softwaretool.
Stellen Sie gängige Transformations-/Normalisierungsmethoden bereit, die für RNA-seq-Daten verwendet werden, um die Analyse dieser Daten zu unterstützen.
Geben Sie im Menü „Spalten“ oder mit der rechten Maustaste und „Neue Spaltenformel“ Transformationsoptionen an, die diese enthalten. Die Ausgabe sollte keine Spaltenformeln in den Spalten enthalten (diese Methoden werden auf 10.000 Spalten über 100 Proben/Zeilen angewendet).
Handelt es sich um eine externe Kundenanfrage? Geben Sie in diesem Fall bitte den Namen des Kundenkontos sowie die wichtigsten Ansprechpartner und Benutzer an, die die Anfrage gestellt haben.
Ja, USDA-ARS, aber auch üblich bei anderen, die mit dieser Art von Daten arbeiten. war früher bei JMP Genomics.
Gibt es ein konkurrierendes Softwarepaket mit dieser Funktion oder Lösung, die wir kennen sollten? Bitte geben Sie alle Informationen zu konkurrierender Software an, einschließlich Links zu Websites, Demos oder Beispielen.
R/Bioconductor andere Tools zur Genexpressionsanalyse (GeneSpring, Omic Soft usw.)
Wird sich dies auf eine Verlängerung, Erweiterung oder Einführung bei einem Kunden auswirken, und gefährdet dies ein Konto, wenn wir uns nicht darum kümmern? Bitte geben Sie angemessene Details und eine Beschreibung des kontospezifischen Problems an.
Nicht sicher, aber es könnte neue Verkäufe für kleinere Organisationen verhindern, die keine Bioinformatikabteilungen haben, die diese Daten für den Kunden generieren können.
