Qu'est-ce qui a inspiré cette demande de liste de souhaits ? Veuillez décrire le problème actuel qui nécessite une amélioration, ou le nouveau problème à résoudre qui n'est pas facile ou possible pour le moment.
Autoriser des méthodes supplémentaires de normalisation de séquence d'ARN telles que TMM, RPKM, TPM, KDMM, médiane des ratios
Veuillez décrire la fonctionnalité ou la solution nouvelle ou améliorée que vous souhaiteriez voir.
Quelle serait la valeur pour vous et/ou pour les autres utilisateurs si cette nouvelle fonctionnalité était fournie ? Toute information sur la facilité d'utilisation, le temps gagné et la valeur des nouvelles fonctionnalités serait appréciée. S'il s'agit d'une fonctionnalité disponible via d'autres solutions logicielles, veuillez décrire cet outil logiciel.
Fournir des méthodes de transformation/normalisation courantes utilisées pour les données de séquençage d’ARN afin de faciliter l’analyse de ces données.
Dans le menu Cols ou cliquez avec le bouton droit et Nouvelle formule de colonne, fournissez les options de transformation qui les incluent. Le résultat ne doit pas inclure de formules de colonne dans les colonnes (ces méthodes sont appliquées à des dizaines de milliers de colonnes sur des centaines d'échantillons/lignes).
S'agit-il d'une demande d'un client externe ? Si tel est le cas, veuillez fournir le nom du compte client ainsi que les principaux points de contact et utilisateurs qui ont fait la demande.
Oui, USDA-ARS, mais aussi courant parmi d'autres qui travaillent avec ce type de données. était chez JMP Genomics. Aussi Cornell et Cargill
Existe-t-il un progiciel concurrent doté de cette fonctionnalité ou de cette solution dont nous devrions être conscients ? Veuillez fournir toutes les informations possibles sur les logiciels concurrents, y compris des liens vers des sites Web, des démos ou des exemples.
R/Bioconductor autres outils d'analyse de l'expression génique (GeneSpring, Omic Soft, etc.)
Cela aura-t-il un impact sur le renouvellement, l'expansion ou l'adoption chez un client, et cela met-il un compte en danger si nous ne résolvons pas ce problème ? Veuillez fournir des détails raisonnables et une description du problème spécifique au compte.
Pas sûr, mais cela pourrait empêcher de nouvelles ventes pour les petites organisations qui ne disposent pas de services de bioinformatique capables de générer ces données pour le client.
@Chris_Kirchberg - Merci pour votre suggestion! Nous avons pris en compte votre demande et la prendrons en considération.
