是什麼激發了這個願望清單請求? 請描述當前需要改進的問題,或者現在不容易或不可能解決的新問題。
在 JMP Genomics 中,過去有一個選項可以導入 SAM/BAM 文件,然後從這些文件中獲取變異調用。 自 JMP Genomics 停產以來,一些功能已移植到 JMP Pro。 這不是他們中的一個
請描述您希望看到的新的或改進的功能或解決方案。
- 允許導入 SAM/BAM 文件並從這些文件創建變體調用。
- 規格列於此關聯
- 我設想在 JMP Pro 中的“文件”>“打開”下有一個選項允許導入這些文件,然後創建一個變體調用,就像 JMP Genomics 曾經能夠做到的那樣。
如果提供此新功能,對您和/或其他用戶有何價值? 任何有關易用性、節省時間、新功能價值的信息都將不勝感激。 如果這是您通過其他軟件解決方案提供的功能,請描述該軟件工具。
允許在基因組領域導入一種通用文件格式,將遺傳數據導入 JMP Pro 進行分析
這是外部客戶的要求嗎? 如果是,請提供客戶帳戶名稱和主要聯繫人以及提出請求的用戶。
是的,美國農業部-ARS
有沒有我們應該注意的具有此功能或解決方案的競爭軟件包? 請提供有關競爭軟件的所有信息,包括指向網站、演示或示例的鏈接。
R/Bioconductor, SAM 工具
這是否會影響客戶的續訂、擴展或採用,如果我們不解決這個問題,是否會使客戶面臨風險? 請提供帳戶特定問題的合理詳細信息和說明。
該客戶是美國政府客戶,擁有 50 年的許可證,因此即使他們不續簽,他們仍然擁有可以使用很長時間的許可證。 它確實有助於將 JMP Genomics 客戶遷移到 JMP Pro。
作為旁注,我認為我們不應該這樣做,因為還有其他免費工具可以創建變體調用並保存為文本文件或 VCF 文件。 我們不從事生物信息學業務。 代表客戶提交。