Was hat Sie zu dieser Wish List-Anfrage inspiriert? Bitte beschreiben Sie das aktuelle Problem, das verbessert werden muss, oder das neue Problem, das gelöst werden muss und das derzeit nicht einfach oder möglich ist.
In JMP Genomics gab es früher eine Option zum Importieren von SAM/BAM-Dateien und zum Abrufen von Variantenaufrufen aus diesen Dateien. Seit der Einstellung von JMP Genomics wurden einige Funktionen auf JMP Pro portiert. Dies ist nicht einer von ihnen
Bitte beschreiben Sie die neue oder verbesserte Funktion oder Lösung, die Sie sehen möchten.
- Erlauben Sie den Import von SAM/BAM-Dateien und erstellen Sie Variantenaufrufe aus diesen Dateien.
- Darin ist die Spezifikation aufgeführt Verknüpfung
- Ich stelle mir eine Option in JMP Pro unter Datei>Öffnen vor, die es ermöglicht, diese Dateien zu importieren und dann eine Variante zu erstellen, die Aufrufe wie JMP Genomics verwenden können.
Welchen Wert hätte es für Sie und/oder andere Benutzer, wenn diese neue Funktion bereitgestellt wird? Jede Information über Benutzerfreundlichkeit, Zeitersparnis, neuen Funktionswert wäre willkommen. Wenn es sich um eine Funktion handelt, die Ihnen über andere Softwarelösungen zur Verfügung steht, beschreiben Sie bitte dieses Softwaretool.
Ermöglicht das Importieren eines gängigen Dateiformats in das Feld Genomik, um genetische Daten zur Analyse in JMP Pro zu übertragen
Handelt es sich um eine externe Kundenanfrage? Geben Sie in diesem Fall bitte den Namen des Kundenkontos sowie die wichtigsten Ansprechpartner und Benutzer an, die die Anfrage gestellt haben.
Ja, USDA-ARS
Gibt es ein konkurrierendes Softwarepaket mit dieser Funktion oder Lösung, die wir kennen sollten? Bitte geben Sie alle Informationen zu konkurrierender Software an, einschließlich Links zu Websites, Demos oder Beispielen.
R/Bioconductor, SAM-Tools
Wird sich dies auf eine Verlängerung, Erweiterung oder Einführung bei einem Kunden auswirken, und gefährdet dies ein Konto, wenn wir uns nicht darum kümmern? Bitte geben Sie angemessene Details und eine Beschreibung des kontospezifischen Problems an.
Der Kunde ist ein Kunde der US-Regierung und hat eine 50-Jahres-Lizenz, so dass er, selbst wenn er nicht verlängert, immer noch eine Lizenz hat, die lange hält. Es hilft bei der Migration von JMP Genomics-Kunden zu JMP Pro.
Als Randbemerkung denke ich, dass wir dies nicht tun sollten, da es andere kostenlose Tools gibt, die die Variantenaufrufe erstellen und als Textdateien oder VCF-Dateien speichern können. Wir sind nicht im Geschäft der Bioinformatik. Senden Sie dies im Namen des Kunden.
