是什么激发了这个愿望清单请求? 请描述当前需要改进的问题,或者现在不容易或不可能解决的新问题。
在 JMP Genomics 中,过去有一个选项可以导入 SAM/BAM 文件,然后从这些文件中获取变异调用。 自 JMP Genomics 停产以来,一些功能已移植到 JMP Pro。 这不是他们中的一个
请描述您希望看到的新的或改进的功能或解决方案。
- 允许导入 SAM/BAM 文件并从这些文件创建变体调用。
- 规格列于此关联
- 我设想在 JMP Pro 中的“文件”>“打开”下有一个选项允许导入这些文件,然后创建一个变体调用,就像 JMP Genomics 曾经能够做到的那样。
如果提供此新功能,对您和/或其他用户有何价值? 任何有关易用性、节省时间、新功能价值的信息都将不胜感激。 如果这是您通过其他软件解决方案提供的功能,请描述该软件工具。
允许在基因组领域导入一种通用文件格式,将遗传数据导入 JMP Pro 进行分析
这是外部客户的要求吗? 如果是,请提供客户帐户名称和主要联系人以及提出请求的用户。
是的,美国农业部-ARS
有没有我们应该注意的具有此功能或解决方案的竞争软件包? 请提供有关竞争软件的所有信息,包括指向网站、演示或示例的链接。
R/Bioconductor, SAM 工具
这是否会影响客户的续订、扩展或采用,如果我们不解决这个问题,是否会使客户面临风险? 请提供帐户特定问题的合理详细信息和说明。
该客户是美国政府客户,拥有 50 年的许可证,因此即使他们不续签,他们仍然拥有可以使用很长时间的许可证。 它确实有助于将 JMP Genomics 客户迁移到 JMP Pro。
作为旁注,我认为我们不应该这样做,因为还有其他免费工具可以创建变体调用并保存为文本文件或 VCF 文件。 我们不从事生物信息学业务。 代表客户提交。