Modelo de Weibull para la descomposición bacteriana.Me pidieron que hiciera una regresión lineal usando Weibull en jmp. Sólo parece funcionar para datos con una curva positiva (crecimiento), sin embargo, al intentar seleccionar el Weibull para los datos de decaimiento no se puede seleccionar. ¿Hay algún parámetro que me falta o una suposición que no me permite utilizar este modelo?
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Mi experiencia con JMP y SAS es realmente rudimentaria, ¡así que gracias!Re: modelo de Weibull para la descomposición bacteriana¡Gracias por dar más detalles! Y mi suposición podría ser correcta.
Según tu descripción, creo que encontré un artículo muy relacionado con este contexto: Modelado de la dinámica de inactivación por presión de Escherichia coli.
En el artículo, la función (o modelo) de Weibull se destaca a continuación:
Pero en la plataforma Fit Curve, el modelo de crecimiento de Weibull se parece a lo siguiente:
Mientras tanto, el modelo Power se parece a lo siguiente:
Entonces, la función Weibull en el documento coincide con el modelo de potencia en la plataforma Fit Curve, y su Y es logCFU.
Sería útil que le pidieras a quien te asignó la tarea que te proporcione la fórmula exacta de la ecuación, para que puedas retroceder los valores de las estimaciones de tu alfa y beta. En el documento anterior, es posible que el coeficiente 2,303 no exista en su modelo. Y sospecho que su parámetro alfa es "b" en ese artículo, y su beta es "n" en ese artículo. Si todas mis suposiciones se cumplen, aquí están las estimaciones alfa y beta de los resultados del modelo de potencia:
beta = potencia
alfa = (1/abs(Pendiente))^(1/Potencia)
Re: modelo de Weibull para la descomposición bacteriana¡Lo haré lo mejor que pueda!
Los valores de y son el registro del número de bacterias que se estima que hay en una muestra de bacterias extraída de una solución. El número de bacterias se denomina "unidad formadora de colonias", ya que se correlaciona con una bacteria singular que inicia una colonia distinta en una placa de Petri. Tomamos el registro de ese valor ya que es un valor más digerible. Entonces el registro de 9000000 sería 6,9.
Tengo cuatro gráficos. Un control, tres tratamientos experimentales. Para 7 puntos de tiempo tengo tres conjuntos de valores logarítmicos ya que las muestras se tomaron por triplicado. Estoy interesado en hacer un modelo de regresión lineal que me permita ver en qué tratamiento comienza a disminuir antes la cantidad de bacterias. Básicamente, el máximo y el mínimo y el punto de inflexión. Me dijeron que el valor beta de Weibull sería equivalente al punto de inflexión y que el alfa sería el máximo y el mínimo.
¡Agradezco la ayuda! Realmente no esperaba que tanta gente se acercara.Re: modelo de Weibull para la descomposición bacterianaPuede que me equivoque, pero según mi lectura, es posible que le interese alguno de los siguientes:
- Un modelo de Weibull sin logaritmo.
- Un modelo de potencia con logaritmo.
Si puede proporcionar más contexto, eso ayudaría. Por ejemplo, algunos antecedentes sobre los datos y el modelo deseado, de modo que puedan ayudar a una persona que no sea bióloga a comprenderlos. Una referencia al modelo deseado o al tema también podría ayudar.
Re: modelo de Weibull para la descomposición bacterianaPor convención, cuando se cuenta una muestra bacteriana sin unidades formadoras de colonias, se utiliza 0,5. Tomar el registro de eso le da los valores negativos una vez transformados en registro.
Re: modelo de Weibull para la descomposición bacterianaParece que tienes valores Y negativos. Pero su Y es el logaritmo de otra variable basada en el nombre. ¿Cómo se ven los datos antes de la transformación? UFC vs tiempo.
Re: modelo de Weibull para la descomposición bacterianaSí, realmente no entiendo cómo usar estas fórmulas. También parecen depender de un censor y están orientados a fallas de equipos.A continuación adjunto cómo se ven mis gráficos. Son simplemente Tiempo en la X y un recuento de bacterias en la Y. Una página de soporte de JMP para las Opciones de ajuste de curva estipula que un modelo de crecimiento de Weibell solo está disponible cuando tanto los valores de respuesta como los valores del regresor no son negativos. Entonces no entiendo por qué investigadores anteriores pudieron usar este modelo para gráficos similares.
Re: modelo de Weibull para la descomposición bacterianaJMP pro 16.0
Puedo ejecutar Gompertz en el menú Ajustar curva. La razón por la que quiero utilizar el modelo de Weibull es para poder ver el punto de inflexión donde se produce la descomposición de las bacterias.
Re: modelo de Weibull para la descomposición bacterianaBienvenido a la comunidad. ¿Has mirado aquí?
https://www.jmp.com/support/help/en/17.0/?os=mac&source=application#page/jmp/statistical-details-for-the-fit-parametric-survival-platform.shtml#ww256757
Re: modelo de Weibull para la descomposición bacteriana¿Qué plataforma estás usando? ¿Qué modelo estás posando?
