Modello Weibull per il decadimento battericoMi è stato chiesto di eseguire una regressione lineare utilizzando Weibull su jmp. Sembra funzionare solo per i dati con una curva positiva (crescita), tuttavia, quando si tenta di selezionare il Weibull per i dati di decadimento non è possibile selezionarlo. C'è un parametro che mi manca o un presupposto che non mi consente di utilizzare questo modello?
Modellazione statistica avanzataAnalisi e modellazione dei dati di baseRicerche sui consumatori e sul mercatoCombinazione e pulizia dei datiEsplorazione e visualizzazione dei datiProgettazione di esperimentiModellazione predittiva e machine learningfinestreRe: Modello Weibull per il decadimento battericoVedrò cosa dice. Ha avuto un articolo precedente che confrontava diversi modelli... ma non riesce a ricordare come abbia fatto.
La mia esperienza con JMP e SAS è davvero rudimentale quindi grazie!Re: Modello Weibull per il decadimento battericoGrazie per l'elaborazione! E la mia ipotesi potrebbe essere corretta.
Secondo la tua descrizione, penso di aver trovato un articolo strettamente correlato a questo contesto: Modellazione della dinamica di inattivazione della pressione di Escherichia coli
Nel documento la funzione (o modello) di Weibull è evidenziata come segue:
Ma nella piattaforma Fit Curve, il modello di crescita di Weibull è simile al seguente:
Nel frattempo, il modello Power è simile al seguente:
Pertanto, la funzione Weibull nel documento corrisponde al modello di potenza nella piattaforma Fit Curve e il tuo Y è logCFU.
Ti sarebbe utile chiedere a chi ti ha dato l'incarico di fornire la formula esatta dell'equazione, così potrai arretrare i valori delle stime del tuo alfa e beta. Nel documento precedente, il coefficiente 2.303 potrebbe non esistere nel tuo modello. E sospetto che il tuo parametro alfa sia la "b" in quel documento, e il tuo beta sia "n" in quel documento. Se tutte le mie ipotesi sono valide, ecco le stime alfa e beta derivanti dai risultati del modello di potenza:
beta = Potenza
alfa = (1/abs(Pendenza))^(1/Potenza)
Re: Modello Weibull per il decadimento battericoFarò del mio meglio!
I valori y sono il logaritmo del numero di batteri stimato presente in un campione di batteri prelevato da una soluzione. Il numero di batteri viene definito “unità formante colonie” poiché è correlato a un singolo batterio che inizia una colonia distinta su una capsula di Petri. Prendiamo il logaritmo di quel valore poiché è un valore più digeribile. Quindi il logaritmo di 9000000 sarebbe 6,9.
Ho quattro grafici. Un controllo, tre trattamenti sperimentali. Per 7 punti temporali ho tre serie di valori logaritmici poiché i campioni sono stati prelevati in triplicato. Sono interessato a creare un modello di regressione lineare che mi permetta di vedere in quale trattamento inizia prima a diminuire la quantità di batteri. Fondamentalmente, il massimo, il minimo e il punto di flesso. Mi è stato detto che il valore beta di Weibull sarebbe equivalente al punto di flesso e l'alfa sarebbe il massimo e il minimo.
Apprezzo l'aiuto! Davvero non mi aspettavo così tante persone a contattarmi.Re: Modello Weibull per il decadimento battericoPotrei sbagliarmi, ma in base alla mia lettura, potresti essere interessato a uno dei seguenti:
- Un modello Weibull senza logaritmo.
- Un modello di potenza con logaritmo.
Se potessi fornire più contesto, sarebbe d'aiuto. Ad esempio, un po' di informazioni generali sui dati e sul modello desiderato, in modo che possano aiutare un non biologo a comprendere. Anche un riferimento al modello desiderato o al soggetto potrebbe aiutare.
Re: Modello Weibull per il decadimento battericoPer convenzione quando si conta un campione batterico senza unità formanti colonie si usa 0,5. Prendendo il log di questo ti dà i valori negativi una volta trasformati in log.
Re: Modello Weibull per il decadimento battericoSembra che tu abbia valori Y negativi. Ma il tuo Y è il logaritmo di un'altra variabile basata sul nome. Come appaiono i dati prima della trasformazione? CFU contro tempo.
Re: Modello Weibull per il decadimento battericoSì, non capisco davvero come usare queste formule. Sembrano anche fare affidamento su un censore e sono orientati ai guasti delle apparecchiature.Di seguito ho allegato come appaiono i miei grafici. Sono semplicemente il tempo sulla X e la conta batterica sulla Y. Una pagina di supporto JMP per le Opzioni di adattamento curva stabilisce che un modello di crescita di Weibell è disponibile solo quando sia i valori di risposta che i valori di regressore non sono negativi. Quindi sono confuso sul motivo per cui i ricercatori precedenti sono stati in grado di utilizzare questo modello per grafici simili.
Re: Modello Weibull per il decadimento battericoJMP professionale 16.0
Sono in grado di eseguire Gompertz nel menu Adatta curva. Il motivo per cui voglio utilizzare il modello Weibull è che così posso vedere il punto di flesso in cui avviene il decadimento dei batteri.
Re: Modello Weibull per il decadimento battericoBenvenuto nella comunità. Hai guardato qui:
https://www.jmp.com/support/help/en/17.0/?os=mac&source=application#page/jmp/statistical-details-for-the-fit-parametric-survival-platform.shtml#ww256757
Re: Modello Weibull per il decadimento battericoQuale piattaforma stai utilizzando? Quale modella stai posando?
