Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneOn m'a demandé de faire une régression linéaire en utilisant Weibull sur jmp. Cela semble fonctionner uniquement pour les données avec une courbe positive (croissance), cependant, lorsque vous essayez de sélectionner le Weibull pour les données de désintégration, il ne peut pas être sélectionné. Y a-t-il un paramètre qui me manque ou une hypothèse qui ne me permet pas d'utiliser ce modèle ?
Modélisation statistique avancéeAnalyse et modélisation des données de baseÉtudes de consommation et de marchéMélange et nettoyage des donnéesExploration et visualisation des donnéesConception d'expériencesModélisation prédictive et apprentissage automatiqueles fenêtresRe: Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneJe verrai ce qu'il dit. Il a déjà publié un article comparant différents modèles… mais il ne se souvient plus comment il l'a fait.
Mon expérience avec JMP et SAS est vraiment rudimentaire alors merci !Re: Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneMerci d'avoir élaboré ! Et ma supposition est peut-être correcte.
D'après votre description, je pense avoir trouvé un article étroitement lié à ce contexte : Modélisation de la dynamique d'inactivation par pression d'Escherichia coli
Dans l'article, la fonction (ou modèle) de Weibull est mise en évidence comme suit :
Mais sur la plateforme Fit Curve, le modèle de croissance Weibull ressemble à ce qui suit :
Pendant ce temps, le modèle Power ressemble à ceci :
Ainsi, la fonction Weibull dans l'article correspond à la plate-forme Power Model in Fit Curve, et votre Y est logCFU.
Il serait utile que vous demandiez à celui qui vous a confié la tâche de fournir la formule exacte de l'équation, afin que vous puissiez annuler les valeurs des estimations de votre alpha et de votre bêta. Dans l'article ci-dessus, le coefficient 2,303 n'existe peut-être pas dans votre modèle. Et je soupçonne que votre paramètre alpha est le « b » dans cet article, et votre bêta est « n » dans cet article. Si toutes mes hypothèses sont vraies, voici les estimations alpha et bêta des sorties du Power Model :
bêta = Puissance
alpha = (1/abs (pente)) ^ (1/puissance)
Re: Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneJe ferai de mon mieux!
Les valeurs y sont le log du nombre de bactéries estimé dans un échantillon de bactéries prélevé dans une solution. Le nombre de bactéries est appelé « unité formant colonie » car il est corrélé à une bactérie unique démarrant une colonie distincte sur une boîte de Pétri. Nous prenons le journal de cette valeur car c'est une valeur plus digeste. Le journal de 9 000 000 serait donc 6,9.
J'ai quatre graphiques. Un contrôle, trois traitements expérimentaux. Pour 7 points dans le temps, j'ai trois ensembles de valeurs log car les échantillons ont été prélevés en triple. Je souhaite créer un modèle de régression linéaire qui me permette de voir à quel moment le traitement commence à diminuer la quantité de bactéries le plus tôt possible. Fondamentalement, le maximum et le minimum et le point d'inflexion. On m'a dit que la valeur bêta de Weibull serait équivalente au point d'inflexion et que l'alpha serait le maximum et le minimum.
J'apprécie l'aide! Je ne m’attendais vraiment pas à ce qu’autant de personnes me contactent.Re: Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneJe me trompe peut-être, mais d'après mes lectures, l'un des éléments suivants pourrait vous intéresser :
- Un modèle de Weibull sans logarithme.
- Un modèle de puissance avec logarithme.
Si vous pouvez fournir plus de contexte, cela aiderait. Par exemple, un peu d'information sur les données et le modèle souhaité, afin qu'ils puissent aider un non-biologiste à comprendre. Une référence au modèle ou au sujet souhaité peut également aider.
Re: Modèle Weibull pour la désintégration bactériennePar convention, lorsque vous comptez un échantillon bactérien sans aucune unité formant colonie, vous utilisez 0,5. Prendre le journal de cela vous donne les valeurs négatives une fois transformées en journal.
Re: Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneIl semble que vous ayez des valeurs Y négatives. Mais votre Y est le logarithme d'une autre variable basée sur le nom. À quoi ressemblent les données avant transformation ? UFC contre temps.
Re: Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneJe l'ai, je ne comprends pas trop comment utiliser ces formules. Ils semblent également s'appuyer sur une censure et s'orienter vers les pannes d'équipements.Ci-dessous, j'ai joint à quoi ressemblent mes graphiques. Il s'agit simplement du temps sur le X et d'un décompte bactérien sur le Y. Une page de support JMP pour les options de courbe d'ajustement stipule qu'un modèle de croissance Weibell n'est disponible que lorsque les valeurs de réponse et les valeurs du régresseur ne sont pas négatives. Je ne comprends donc pas pourquoi les chercheurs précédents ont pu utiliser ce modèle pour des graphiques similaires.
Re: Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneJMP pro 16.0
Je suis capable d'exécuter Gompertz dans le menu Fit Curve. La raison pour laquelle je souhaite utiliser le modèle de Weibull est de pouvoir voir le point d'inflexion où se produit la décomposition des bactéries.
Re: Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneBienvenue dans la communauté. As-tu regardé ici :
https://www.jmp.com/support/help/en/17.0/?os=mac&source=application#page/jmp/statistical-details-for-the-fit-parametric-survival-platform.shtml#ww256757
Re: Modèle Weibull pour la désintégration bactérienneQuelle plateforme utilisez-vous ? Quel modèle posez-vous ?
