回复:二項式廣義回歸探查器中的寬置信區間歡迎來到社區。 我不確定我是否可以在此論壇上提供您需要的有關建模的所有建議。 您使用的是什麼版本的 JMP? 在如此少的上下文中提供建議也非常困難。 回應是什麼? 您對響應的測量有多大信心? 你是怎麼得到數據集的?
有許多統計數據可用於評估過度擬合(例如,將 RSquare 與 RSquare Adj 進行比較。 隨著此 delta 的增加,這表明您在模型中有不重要的項,負 R 方來自驗證數據集). 看你發的pdf(附上數據表我們看你有什麼就容易多了),很難評估。 R 方表明您的模型解釋了 <30% 的數據變異。 基因 4 似乎是唯一有趣的基因(相對顯著的 p 值)。 標準誤差似乎很大。
您可能會發現這些鏈接有幫助
https://www.jmp.com/support/help/en/17.0/?os=mac&source=application#page/jmp/estimation-method-options.shtml
https://www.jmp.com/support/help/en/17.1/index.shtml#page/jmp/example-of-the-model-comparison-table-in-generalized-regression.shtml#
回复:二項式廣義回歸探查器中的寬置信區間您可以使用某種形式的交叉驗證來評估欠擬合或過度擬合數據的偏差和方差。
與定量響應相比,二項式或二分式響應通常在預測中顯示出更高程度的不確定性。
預期或可接受的問題是主觀的。 沒有外部規則或指導。
二項式廣義回歸刻畫器中的寬置信區間大家好,
我正在做預測建模,並希望獲得有關我的模型擬合程度的回饋,因為我是建模新手,不想在模型選擇中犯任何錯誤。我有二項式分類反應和連續預測變數(n=54,p=15)。我選擇了一個懲罰模型 Elastic Net,我的模型似乎擬合得很好(RSquare = .28,ROC = .7888,附有 pdf 檔)。
我擔心分析器圖表中顯示的大置信區間,並希望確保我的模型不會過度擬合。話雖如此,jmp 文件中顯示的範例二項式一般迴歸也具有廣泛的置信區間,所以我想知道二項式一般迴歸可接受/預期的內容( https://www.jmp.com/support/ help/en /17.1/index.shtml#page/jmp/example-of-binomial-generalized-regression.shtml# )。
對於我的模型是否顯示出過度擬合的跡像或看起來是否可以安全地繼續,您有任何反饋嗎?在評估我的適合度時我還應該考慮其他指標嗎?
預先感謝您查看此內容!
數據探索和視覺化回复:二項式廣義回歸探查器中的寬置信區間嗨,馬克,
感謝您的答复!! 我使用 AICc 作為驗證,鑑於我的小樣本量 n=54,我認為這是最佳選擇。 您會推薦使用 k 折還是留一法?
至於不確定性:我的目標之一是能夠指出哪些基因與響應呈正相關(即,當基因計數較高時,響應的概率較高)。 如果有這麼大的置信區間,我是否無法做到這一點? 我選擇使用懲罰回歸模型是最好的方法嗎,或者您是否會推薦另一種方法可以為小樣本量提供更多確定性? 我研究了很多方法,對於預測變量數量大於 n/10 的情況(根據 Frank Harrel 博士關於廣義回歸和其他來源的書),懲罰模型似乎更受歡迎。 但如果它不合適,我想應該考慮其他方法。 另外,我只是將我的數據表附在了我的問題上。
我不確定這個論壇的範圍是什麼,所以如果我的問題超出了範圍,我深表歉意! 如果您不能回答他們,請不要擔心:)謝謝!
回复:二項式廣義回歸探查器中的寬置信區間嗨斯塔特曼,
感謝您的答复!! 我已將數據表附加到我的原始問題中。 我必須保護一定程度的機密性,但我可以說響應是醫學診斷,並且是根據醫學指南確定的。 根據這些指南,我確信診斷是正確的。 預測變量來自我們生成的深度測序數據。 我們從 6,000 個測量響應開始,我已經完成了數據縮減(對這些樣本視而不見);在盡可能減少之後,我最終得到了 15 個預測變量。
JMP 的預測因子查找器可能會突出顯示比我最終得到的 15 個更好的預測因子,但是,文獻似乎正在朝著臨床追求的盲數據減少方法發展。 我同意 Gene 4 似乎是這批產品中唯一的重要預測因子。
感謝您提供有關查看 R^2 調整中的過度擬合指示的提示。價值。 該值似乎未包含在我的輸出中。 你知道我能生產嗎? 謝謝!!
回复:二項式廣義回歸探查器中的寬置信區間AICc 是關於候選人之間的模型選擇。 它不涉及驗證。 JMP 提供多種交叉驗證方法,具體取決於您使用的是 JMP 還是 JMP Pro。 K-fold XV 通常是小數據集的不錯選擇。 比較訓練集和驗證集之間的 AICc。 他們不應該有很大的不同。
回复:二項式廣義回歸探查器中的寬置信區間我了解數據的敏感性,但表中缺少響應,因此無法建模。 我所能做的就是對基因進行多變量分析(並且有一些異常值)。
不好意思,我忍不住了(沒有敵對的意思,請幽默一下):
對於這個評論,我不得不笑。 “噸他的反應是醫學診斷,是根據醫學指南確定的。 根據這些指南,我確信診斷是正確的。” 不是像哈哈那樣笑,而是笑基於指南. 指南是定義性的,而不是最終的。 我患有一種罕見的自身免疫疾病,被多位醫生多次誤診。使用醫學指南(臨床指南)...
R 方:
https://www.jmp.com/support/help/en/17.0/?os=mac&source=application#page/jmp/statistical-details-for-the-summary-of-fit-report.shtml