回复:二项式广义回归探查器中的宽置信区间欢迎来到社区。 我不确定我是否可以在此论坛上提供您需要的有关建模的所有建议。 您使用的是什么版本的 JMP? 在如此少的上下文中提供建议也非常困难。 回应是什么? 您对响应的测量有多大信心? 你是怎么得到数据集的?
有许多统计数据可用于评估过度拟合(例如,将 RSquare 与 RSquare Adj 进行比较。 随着此 delta 的增加,这表明您在模型中有不重要的项,负 R 方来自验证数据集). 看你发的pdf(附上数据表我们看你有什么就容易多了),很难评估。 R 方表明您的模型解释了 <30% 的数据变异。 基因 4 似乎是唯一有趣的基因(相对显着的 p 值)。 标准误差似乎很大。
您可能会发现这些链接有帮助
https://www.jmp.com/support/help/en/17.0/?os=mac&source=application#page/jmp/estimation-method-options.shtml
https://www.jmp.com/support/help/en/17.1/index.shtml#page/jmp/example-of-the-model-comparison-table-in-generalized-regression.shtml#
回复:二项式广义回归探查器中的宽置信区间您可以使用某种形式的交叉验证来评估欠拟合或过度拟合数据的偏差和方差。
与定量响应相比,二项式或二分式响应通常在预测中显示出更高程度的不确定性。
预期或可接受的问题是主观的。 没有外部规则或指导。
刻画器中二项广义回归的置信区间较宽大家好,
我正在做预测建模,非常希望大家能对我的模型拟合效果提出反馈,因为我刚开始做建模,不想在模型选择上犯任何错误。我有一个二项分类响应和连续预测变量(n=54,p=15)。我选择了惩罚模型 Elastic Net,我的模型似乎拟合效果不错(RSquare = .28,ROC = .7888,附有 pdf 文件)。
我担心刻画器图表中显示的置信区间过大,并希望确保我的模型不会过度拟合。话虽如此,jmp 文档中显示的示例二项式广义回归也具有较宽的置信区间,因此我想知道二项式广义回归的可接受/预期值是多少( https://www.jmp.com/support/help/en/17.1/index.shtml#page/jmp/example-of-binomial-generalized-regression.shtml# )。
您对我的模型是否显示出过度拟合的迹象或是否可以继续进行有任何反馈吗?在评估我的拟合度时,我还应该考虑其他指标吗?
提前感谢您查看此内容!
数据探索与可视化回复:二项式广义回归探查器中的宽置信区间嗨,马克,
感谢您的答复!! 我使用 AICc 作为验证,鉴于我的小样本量 n=54,我认为这是最佳选择。 您会推荐使用 k 折还是留一法?
至于不确定性:我的目标之一是能够指出哪些基因与反应呈正相关(即,当基因计数较高时,反应的概率较高)。 如果有这么大的置信区间,我是否无法做到这一点? 我选择使用惩罚回归模型是最好的方法吗,或者您是否会推荐另一种方法可以为小样本量提供更多确定性? 我研究了很多方法,对于预测变量数量大于 n/10 的情况,惩罚模型似乎更受欢迎(根据 Frank Harrel 博士关于广义回归的书和其他来源)。 但如果它不合适,我想应该考虑其他方法。 另外,我只是将我的数据表附在了我的问题上。
我不确定这个论坛的范围是什么,所以如果我的问题超出了范围,我深表歉意! 如果您不能回答他们,请不要担心:)谢谢!
回复:二项式广义回归探查器中的宽置信区间嗨斯塔特曼,
感谢您的答复!! 我已将数据表附加到我的原始问题中。 我必须保护一定程度的机密性,但我可以说响应是医学诊断,并且是根据医学指南确定的。 根据这些指南,我确信诊断是正确的。 预测变量来自我们生成的深度测序数据。 我们从 6,000 个测量响应开始,我已经完成了数据缩减(对这些样本视而不见);在尽可能减少之后,我最终得到了 15 个预测变量。
JMP 的预测因子查找器可能会突出显示比我最终得到的 15 个更好的预测因子,但是,文献似乎正在朝着临床追求的盲数据减少方法发展。 我同意 Gene 4 似乎是这批产品中唯一的重要预测因子。
感谢您提供有关查看 R^2 调整中的过度拟合指示的提示。价值。 该值似乎未包含在我的输出中。 你知道我能生产吗? 谢谢!!
回复:二项式广义回归探查器中的宽置信区间AICc 是关于候选人之间的模型选择。 它不涉及验证。 JMP 提供多种交叉验证方法,具体取决于您使用的是 JMP 还是 JMP Pro。 K-fold XV 通常是小数据集的不错选择。 比较训练集和验证集之间的 AICc。 他们不应该有很大的不同。
回复:二项式广义回归探查器中的宽置信区间我了解数据的敏感性,但表中缺少响应,因此无法建模。 我所能做的就是对基因进行多变量分析(并且有一些异常值)。
不好意思,我忍不住了(没有敌对的意思,请幽默一下):
对于这个评论,我不得不笑。 “吨他的反应是医学诊断,是根据医学指南确定的。 根据这些指南,我确信诊断是正确的。” 不是像哈哈那样笑,而是笑基于指南. 指南是定义性的,而不是最终的。 我患有一种罕见的自身免疫疾病,被多位医生多次误诊。使用医学指南(临床指南)...
R 方:
https://www.jmp.com/support/help/en/17.0/?os=mac&source=application#page/jmp/statistical-details-for-the-summary-of-fit-report.shtml