揭示單細胞數據 3D 矩陣中的基因模式：兩個新 JSL 插件的應用 (2023-EU-30MP-1327)Paul Fogel，顧問，Paul Fogel 顧問
Orson Jay，實習生，賽諾菲
Galina Boldina，賽諾菲首席數據科學家
Franck Augé，賽諾菲組學數據科學高級總監
矩陣是二階張量。 在某些應用中，輸入數據是三階或更高階張量。 例如，來自單個供體的不同細胞類型的基因表達數據形成 {細胞類型 × 基因} 形式的二階張量，而不同供體的相似細胞類型的集合導致三階張量形成{細胞類型×基因×供體}。 我們提供了兩個 JMP 插件，第一個插件使用非負張量分解對三階張量執行多路數據分析。 第二個插件允許以平行熱圖的形式可視化在張量中發現的主要表達模式。 使用公共轉錄組數據集，我們展示了這些工具如何能夠發現和可視化具有相似轉錄組模式的細胞類型、基因和供體的三聚類，從而產生可用於對不同細胞的大量混合物進行反捲積的細胞類型特徵類型。 我們還展示了用於執行核心計算的 Python 包可以無縫集成到 JSL 腳本中。
爆發數據探索JSL 應用程序開發
