Risultati diversi dei componenti della varianza REML per ordini diversi degli stessi fattoriCiao,
Ho progettato uno studio con 5 fattori (settimana, lotto, ecc.) per due laboratori diversi e uno dei laboratori ha seguito la progettazione in modo errato. Hanno comunque completato tutte le parti dello studio e il progetto è ancora bilanciato, hanno semplicemente invertito l'ordine del progetto per le settimane 2 e 3. Sto analizzando i dati per entrambi i laboratori combinati. Pertanto il laboratorio 1 ha eseguito la progettazione nell'ordine delle settimane 1-2-3-4, ma il laboratorio 2 ha eseguito la progettazione nell'ordine delle settimane 1-3-2-4 (secondo la progettazione pianificata). Ho analizzato i dati in 2 modi: una volta mantenendo i numeri reali delle settimane eseguite e una volta sovrascrivendo i dati del laboratorio 2 per seguire il progetto (scambiando i dati per le settimane 2 e 3, quindi sembra che abbiano eseguito il progetto nel modo corretto ordine 1-2-3-4). Non pensavo che questo passaggio avrebbe avuto un impatto sui risultati dell'analisi dei componenti della varianza REML, poiché tutte le parti erano ancora completate e il progetto era ancora bilanciato, ma le stime e le percentuali dei componenti della varianza sono leggermente diverse tra le due analisi.
Qualcuno può spiegarmi perché le stime dei componenti di varianza sarebbero diverse quando cambio semplicemente l'ordine delle settimane? La variabilità imputabile alla settimana non viene valutata allo stesso modo?
Grazie!
Condivisione e comunicazione dei risultatifinestreRi: Diversi risultati della componente di varianza REML per ordine diverso degli stessi fattoriSenza vedere i dati e le specifiche complete del modello che stai cercando di adattare, è difficile rispondere.
In base alle informazioni che hai fornito, ciò potrebbe essere dovuto al fatto che il fattore "Settimana" sia specificato o meno come nidificato o meno.Se non è specificato come nidificato, si presume che il fattore settimana sia condiviso dai laboratori.La nidificazione implica che la settimana 1 nel laboratorio 1 non è la stessa della settimana 1 nel laboratorio 2, ad esempio.La settimana 1 potrebbe avere un effetto diverso su Lab1 rispetto alla settimana 1 su Lab 2.
Senza nidificazione, presumi che la settimana 1 abbia lo stesso effetto su Lab1 e Lab2.In altre parole, stai stimando una variabilità settimanale comune in entrambi i laboratori.
Probabilmente è ragionevole pensare che i livelli settimanali dell'Esercitazione 1 siano diversi dai livelli settimanali dell'Esercitazione 2, ma forse no se c'è qualche fattore in agguato comune che influisce su entrambi i laboratori ogni settimana in modo simile.
Ri: Diversi risultati della componente di varianza REML per ordine diverso degli stessi fattoriPotrebbe avere a che fare con quali termini sono incrociati o nidificati?
Ri: Diversi risultati della componente di varianza REML per ordine diverso degli stessi fattoriIn realtà, questo progetto è più accurato, poiché i laboratori hanno utilizzato lotti, operatori e attrezzature diversi.
Ri: Diversi risultati della componente di varianza REML per ordine diverso degli stessi fattoriNon ho settimana come annidato. Sto eseguendo l'analisi REML in JMP con tutti e 5 i fattori come casuali. Penso di avere difficoltà a determinare cosa dovrebbe essere nidificato o meno. In allegato il progetto di studio previsto. La settimana dovrebbe essere nidificata all'interno del laboratorio?
Ri: Diversi risultati della componente di varianza REML per ordine diverso degli stessi fattori
Quindi Lotto, Operatore e Attrezzatura vengono nidificati all'interno di Lab
Ri: Diversi risultati della componente di varianza REML per ordine diverso degli stessi fattoriGrazie! Da questa discussione e dalla mia lettura nel frattempo, credo che questo (immagine allegata) sia il modo corretto per eseguire l'analisi della componente della varianza. Il sito è la variabile Lab ed è stata eseguita 1 corsa per ciascuna combinazione di fattori mostrata nel disegno. Sono sulla strada giusta?
Ri: Diversi risultati della componente di varianza REML per ordine diverso degli stessi fattoriCi sono poche informazioni preziose per determinare se sei sulla strada giusta o no; ma (e se ho capito bene), se è stata eseguita 1 "corsa" per ogni combinazione, qual è l'effetto Corsa[Sito, Settimana, Lotto, Operatore, Attrezzatura]?cioè, è la variabilità tra le corse?Se è così, e c'è solo 1 esecuzione per combinazione, allora come può essere variabilità tra le esecuzioni? E, se non ti dispiace che te lo chieda, perché il sito è casuale? Se stai cercando di confrontare solo quei due siti particolari, allora non è casuale. E, se è casuale ... allora stimare una componente di varianza con n = 2 siti è sconsigliato.
Ri: Diversi risultati della componente di varianza REML per ordine diverso degli stessi fattoriRimuoverei il termine Run dal modello. La corsa verrà implicitamente utilizzata per stimare la ripetibilità. Questo cambiamento affronterà @MRB3855 osservazione che è necessaria più di una corsa per ogni combinazione per stimare la varianza.
