同一因子不同顺序产生的不同 REML 方差分量结果你好，
我为两个不同的实验室设计了一项包含 5 个因素（周、批次等）的研究，其中一个实验室没有按顺序执行设计。他们仍然完成了研究的所有部分，设计仍然是平衡的，他们只是切换了第 2 周和第 3 周的设计顺序。我正在分析两个实验室的综合数据。因此，实验室 1 按照第 1-2-3-4 周的顺序运行设计，但实验室 2 按照第 1-3-2-4 周的顺序运行设计（按照计划的设计）。我以两种方式分析数据：一次保留执行的真实周数，一次覆盖实验室 2 的数据以遵循设计（交换第 2 周和第 3 周的数据，因此看起来他们按照正确的 1-2-3-4 顺序运行设计）。我不认为这种切换会对 REML 方差分量分析结果产生影响，因为所有部分仍然完成，设计仍然是平衡的，但两次分析之间的方差分量估计值和百分比略有不同。
有人能解释一下为什么当我只是改变周的顺序时，方差分量估计值会有所不同吗？归因于周的变异性不是以相同的方式评估的吗？
谢谢你！
分享和交流结果视窗回复：相同因素不同顺序的不同 REML 方差分量结果如果没有看到您要拟合的模型的数据和完整规格，这很难回答。
根据您提供的信息，这可能是由于“周”因素是否被指定为嵌套造成的。如果未指定为嵌套，则假定周因子由实验室共享。例如，嵌套意味着实验 1 中的第 1 周与实验 2 中的第 1 周不同。第 1 周对 Lab1 的影响可能与第 1 周对 Lab 2 的影响不同。
在没有嵌套的情况下，您假设第 1 周对 Lab1 和 Lab2 具有相同的效果。也就是说，您正在估计两个实验室之间常见的每周变化。
认为实验室 1 中的周水平与实验室 2 中的周水平不同可能是合理的，但如果有一些共同的潜伏因素每周以类似的方式影响两个实验室，则可能不是。
回复：相同因素不同顺序的不同 REML 方差分量结果可能与哪些术语交叉或嵌套有关？
回复：相同因素不同顺序的不同 REML 方差分量结果实际上，这种设计更准确，因为实验室使用了不同的批次、操作员和设备。
回复：相同因素不同顺序的不同 REML 方差分量结果我没有嵌套的星期。 我在 JMP 中运行 REML 分析，所有 5 个因素都是随机的。 我想我很难确定什么应该嵌套或不嵌套。 附件是计划的研究设计。 周应该嵌套在实验室内吗？
回复：相同因素不同顺序的不同 REML 方差分量结果
然后 Lot、Operator 和 Equipment 嵌套在 Lab 中
回复：相同因素不同顺序的不同 REML 方差分量结果谢谢你！ 从这个讨论和我自己的同时阅读，我相信这个（附图）是运行方差分量分析的正确方法。 Site 是 Lab 变量，对设计中显示的每个因素组合执行 1 次运行。 我在正确的轨道上吗？
回复：相同因素不同顺序的不同 REML 方差分量结果很少有宝贵的信息可以确定您是否在正确的轨道上；但是（如果我理解正确的话），如果对每个组合执行 1 次“运行”，运行 [Site、Week、Lot、Operator、Equipment] 效果是什么？即，它是运行之间的可变性？如果是这样，并且每个组合只有 1 次运行，那么运行之间如何变化？ 而且，如果您不介意我问，为什么网站是随机的？ 如果您只想比较这两个特定站点，那么它就不是随机的。 而且，如果它是随机的……那么估计 n=2 个站点的方差分量是不明智的。
回复：相同因素不同顺序的不同 REML 方差分量结果我将从模型中删除运行项。 运行将隐含地用于估计可重复性。 此更改将解决@MRB3855观察到每个组合需要多次运行才能估计方差。
