是什么激发了这个愿望清单请求?
目前这是不可能的,我们要求客户从使用 JMP/JMP Pros 转换列表之外的方法标准化的数据开始。 这可行,但这意味着在 JMP/JMP Pro 中使用之前必须先使用 JMP 之外的另一个工具。
请描述您希望看到的新的或改进的功能或解决方案。
此参考总结了问题:
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1874-1
我们可以对列进行 log2(x+1) 转换,这似乎是一个可以接受的替代方案,但在计数数据方面也有其自身的问题,这些数据也非常稀疏。
为单细胞 RNA-seq 数据添加一些添加方法(VST 和/或分散)将有助于解决其中一些问题。
如果提供此新功能,对您和/或其他用户有何价值?
在 JMP 中做更多事情,而不必先使用其他工具,这可能会吸引客户留在该工具中,而不是转到 JMP/JMP Pro
这是外部客户的要求吗?
是的,Ionis Pharmaceutical
有没有我们应该注意的具有此功能或解决方案的竞争软件包?
R/Bioconductor是竞争的主要来源。
这是否会影响客户的续订、扩展或采用,如果我们不解决这个问题,是否会使客户面临风险?
客户正在针对此类数据评估 JMP Pro。 目前他们可以获得标准化数据,这可能对该客户的影响很小,但能够启动并留在 JMP Pro 中可能会影响他们。 评估会发生什么还有待观察。