このウィッシュ リスト リクエストのきっかけは何ですか?
現在、これは不可能であり、JMP/JMP Pros の変換リスト以外の方法で正規化されたデータから開始する必要があります。 これは機能しますが、JMP/JMP Pro で使用する前に、JMP 以外の別のツールを使用する必要があります。
ご希望の新機能または改善された機能またはソリューションについて説明してください。
このリファレンスは問題を要約しています:
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1874-1
列に対して log2(x+1) 変換を行うことができますが、これは許容できる代替手段のように見えますが、非常にまばらなカウント データにも独自の問題があります。
単一細胞 RNA-seq データにいくつかの追加メソッド (VST および/または分散) を追加すると、これらの問題のいくつかに役立ちます。
この新機能が提供された場合、あなたや他のユーザーにとってどのような価値がありますか?
最初に他のツールを使用する代わりに、JMP 内でより多くのことを行うことができます。これにより、顧客は JMP/JMP Pro に行く代わりにそのツールを使用し続けるようになる可能性があります。
これは外部の顧客の要求ですか?
はい、イオニス製薬です
知っておくべきこの機能またはソリューションを備えた競合ソフトウェア パッケージはありますか?
R/Bioconductor は競合の主な原因です。
これは顧客での更新、拡張、または採用に影響を与えますか? また、これに対処しない場合、アカウントが危険にさらされますか?
お客様は、この種のデータについて JMP Pro を評価しています。 現在、彼らは正規化されたデータを取得でき、この顧客への影響は少ないかもしれませんが、JMP Pro を開始してそのままにしておくことができれば、彼らは動揺するかもしれません。 評価がどうなるかはまだ分からない。
