是什麼激發了這個願望清單請求?
目前這是不可能的,我們要求客戶從使用 JMP/JMP Pros 轉換列表之外的方法標準化的數據開始。 這可行,但這意味著在 JMP/JMP Pro 中使用之前必須先使用 JMP 之外的另一個工具。
請描述您希望看到的新的或改進的功能或解決方案。
此參考總結了問題:
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1874-1
我們可以對列進行 log2(x+1) 轉換,這似乎是一個可以接受的替代方案,但在計數數據方面也有其自身的問題,這些數據也非常稀疏。
為單細胞 RNA-seq 數據添加一些添加方法(VST 和/或分散)將有助於解決其中一些問題。
如果提供此新功能,對您和/或其他用戶有何價值?
在 JMP 中做更多事情,而不必先使用其他工具,這可能會吸引客戶留在該工具中,而不是轉到 JMP/JMP Pro
這是外部客戶的要求嗎?
是的,Ionis Pharmaceutical
有沒有我們應該注意的具有此功能或解決方案的競爭軟件包?
R/Bioconductor是競爭的主要來源。
這是否會影響客戶的續訂、擴展或採用,如果我們不解決這個問題,是否會使客戶面臨風險?
客戶正在針對此類數據評估 JMP Pro。 目前,他們可以獲得標準化數據,這可能對該客戶的影響很小,但能夠啟動並留在 JMP Pro 中可能會影響他們。 評估會發生什麼還有待觀察。