揭示单细胞数据 3D 矩阵中的基因模式：两个新 JSL 插件的应用 (2023-EU-30MP-1327)Paul Fogel，顾问，Paul Fogel 顾问
Orson Jay，实习生，赛诺菲
Galina Boldina，赛诺菲首席数据科学家
Franck Augé，赛诺菲组学数据科学高级总监
矩阵是二阶张量。 在某些应用中，输入数据是三阶或更高阶张量。 例如，来自单个供体的不同细胞类型的基因表达数据形成 {细胞类型 × 基因} 形式的二阶张量，而不同供体的相似细胞类型的集合导致三阶张量形成{细胞类型×基因×供体}。 我们提供了两个 JMP 插件，第一个插件使用非负张量分解对三阶张量执行多路数据分析。 第二个插件允许以平行热图的形式可视化在张量中发现的主要表达模式。 使用公共转录组数据集，我们展示了这些工具如何能够发现和可视化具有相似转录组模式的细胞类型、基因和供体的三聚类，从而产生可用于对不同细胞的大量混合物进行反卷积的细胞类型特征类型。 我们还展示了用于执行核心计算的 Python 包可以无缝集成到 JSL 脚本中。
爆发数据探索JSL 应用程序开发
